これは、オンライン Linux で実行する isiKnock という名前の Linux アプリで、最新リリースは isiKnockv1.0.0.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
isiKnock という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショット：
Linux でオンラインで実行する isiKnock
説明：
シグナル伝達経路は複雑で絡み合ったプロセスです。 生体系の混乱は、経路構成要素の複雑な相互作用や依存関係を明らかにする可能性があります。isiKnock は、シグナル伝達経路のインシリコノックアウトを自動的に実行および視覚化するソフトウェアです (Hannig et al. 2019)。 isiKnock は、定常状態での信号の流れの計算に基づいてノックアウト動作を予測します。 インシリコノックアウトの概念の説明については、Sheidel et al. を参照してください。 2016 およびアムシュタインら。 2017年。
ハニッグら。 (2019) isiKnock: シグナル伝達経路におけるインシリコノックアウト、バイオインフォマティクス、35(5)、892–894
アムシュタインら。 (2017) マナティーの不変条件は、シグナル伝達ネットワークの機能的経路を明らかにします。 BMC システム生物学、11(1)、72。
シャイデルら。 (2016) サルモネラ菌の異物捕獲に関するインシリコノックアウト研究。 PLoS 計算生物学、12(12)、e1005200。
特徴
- システム生物学
- インシリコノックアウト
- 摂動
これは、https://sourceforge.net/projects/molbi-isiknock/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。