これはScanpyというLinuxアプリで、最新リリースは1.11.4sourcecode.tar.gzとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorks を使用して Scanpy というアプリを無料でダウンロードし、オンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショット：
スキャンピー
説明：
Scanpyは、anndataと共同で開発された、単一細胞遺伝子発現データを解析するためのスケーラブルなツールキットです。前処理、可視化、クラスタリング、トラジェクトリ推定、そして差次的発現テストといった機能を備えています。Pythonベースの実装は、100万個を超える細胞からなるデータセットを効率的に処理します。
オプション
- ドキュメントが利用可能
- 利用可能な例
- Pythonでの単一細胞解析
- 前処理、可視化、クラスタリング、軌道推論などが含まれる。
- Pythonベースの実装は、100万個以上のセルのデータセットを効率的に処理します。
プログラミング言語
Python
カテゴリー
このアプリケーションは、https://sourceforge.net/projects/scanpy.mirror/ からも入手できます。OnWorks でホストされているため、無料のオペレーティングシステムから最も簡単にオンラインで実行できます。