これは、Linux経由でWindows上でオンラインで実行できるGenNon-hというWindowsアプリです。最新リリースはGenNonH_share.zipとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。
GenNon-h というこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux 経由で Windows で無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショット：
GenNon-h は Linux ではなく Windows で実行可能
説明：
多数のソフトウェア パッケージが利用可能です進化したDNA MSAを生成する
系統樹上の連続時間マルコフ過程。 一方で、
遷移行列から直接 DNA MSA をシミュレートする方法
存在しない。 さらに、既存のソフトウェアでは次のような制限があります。
時間可逆モデルであり、次のように最適化されていません。
不均質なデータを生成します (つまり、異なる系統に異なる置換率を配置します)。
GenNon-H は、以下の条件下で複数の配列アラインメントを生成するように設計された最初のパッケージです。
遷移行列から直接サンプリングする系統樹上の離散時間マルコフ処理。
入力モデルと
Newick形式の系統樹（枝の長さを測定したもの）
サイトごとの予想される置換数として）、
アルゴリズムにより、希望の長さの DNA アラインメントが生成されます。
GenNon-H は、以下で説明されている共同プロジェクトです。 http://genome.crg.es/cgi-bin/phylo_mod_sel/AlgGenNonH.pl.
プログラミング言語
C + +
これは https://sourceforge.net/projects/gennonh/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。