これは、MCPerm: モンテカルロ SNP 順列という名前の Windows アプリで、Linux オンライン上で Windows オンラインで実行されます。最新リリースは MCPerm_1.1.2.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
MCPerm: モンテカルロ SNP 順列という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用してオンライン Linux 上で Windows オンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
MCPerm: Linux オンライン上で Windows オンラインで実行するモンテカルロ SNP 順列
説明：
MCPerm：ケースコントロール関連解析における複数のテスト相関のためのモンテカルロ順列法従来の順列（TradPerm）検定は、重要なノンパラメトリック分析法であり、ケースコントロール関連解析における多重検定修正のゴールドスタンダードとして扱うことができます。 ただし、元の一塩基多型（SNP）の遺伝子型と表現型のデータに依存して多数のランダムシャッフルを実行するため、特にゲノムワイド関連解析（GWAS）の場合は計算量が多くなります。 TradPermのp値のサイズを変更せずに計算速度を向上させるために、TradPermの効率的な代替手段としてモンテカルロ順列（MCPerm）メソッドを開発しました。
方法：MCPermは、元の遺伝子型と表現型のデータをシャッフルする必要はありません。 モンテカルロ法を使用し、XNUMX段階の超幾何分布を使用して、症例と対照の遺伝子型（AA、Aa、およびaa）の乱数を生成します。
プログラミング言語
S / R
これは、https：//sourceforge.net/projects/mcperm/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。