이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 garniere 명령입니다.
프로그램:
이름
garnier - GOR 방법을 사용하여 단백질 XNUMX차 구조 예측
개요
가니 에르 -순서 시퀄 -idc 정수 -아웃파일 신고
가니 에르 -도움
기술
가니 에르 EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈"의 명령줄 프로그램입니다.
소프트웨어 제품군”). "단백질:2D 구조" 명령 그룹의 일부입니다.
옵션
입력 섹션에 있어야 합니다.
-순서 시퀄
Advnaced 섹션에 있어야 합니다.
-idc 정수
그들의 논문에서 GOR은 XNUMX차 구조에 대해 알고 있다면 다음과 같이 언급합니다.
분석 중인 단백질의 함량에 따라 더 나은 예측을 할 수 있습니다. 'idc'는
'결정 상수'를 제공하는 배열 세트 dharr[] 및 dsarr[]에 대한 색인
(dch, dcs)는 나선과 시트의 가중치에 적용되는 오프셋입니다.
(확장) 용어. 따라서 idc=0은 결정 상수 오프셋을 사용하지 않는다고 말하고 idc=1 ~ 6은
dch,dcs 오프셋의 다양한 조합을 사용해야 함을 나타냅니다.
산출 섹션에 있어야 합니다.
-아웃파일 신고
onworks.net 서비스를 통해 온라인으로 Garniere를 사용하세요.