masai_output_pe - 클라우드의 온라인

이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 masai_output_pe 명령입니다.

프로그램:

이름


masai_output_pe - Masai 출력 - 페어드 엔드 모드

개요

masai_output_pe [옵션]


기술

Masai는 대략적인 시드 및 다중
역추적.

만나다 http://www.seqan.de/projects/masai

(c) Enrico Siragusa의 저작권 2011-2012.

-h, --도움

이 도움말 메시지를 표시합니다.

--번역

버전 정보를 표시

페어링 옵션:

-ng, --간격 없음

간격으로 읽기를 정렬하지 마십시오.

-NS, --라이브러리 길이 NUM

라이브러리 길이. 기본값: 220.

그들, --라이브러리 오류 NUM

라이브러리 길이 허용 오차. 기본값: 50.

출력 옵션:

-t, --tmp 폴더 STR

거대한 임시 폴더를 지정하십시오. 기본값: 게놈 폴더를 사용합니다.

-o, --결과물 파일 FILE

출력 파일을 지정합니다. 기본값: 읽기 파일 이름 접두사를 사용합니다. 유효한 파일 형식
원시 및 샘입니다.

-체크 안함, --시가 없음

CIGAR 문자열을 출력하지 마십시오. 이는 SAM 출력에만 영향을 줍니다.

디버그 옵션:

-NS, --덤프 없음

결과를 덤프하지 마십시오.

버전

masai_output_pe 버전: 0.7.1 [14053] 마지막 업데이트 2013-05-16

onworks.net 서비스를 사용하여 masai_output_pe 온라인 사용



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