이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 명령 maskeqe입니다.
프로그램:
이름
maskeq - 마스크 영역이 있는 시퀀스 작성
개요
마스크 -순서 순서 -지역 범위 [-낮추다 비녀장] -마스크 문자 현
- outseq 분리
마스크 -도움
기술
마스크 EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈"의 명령줄 프로그램입니다.
소프트웨어 제품군”). "편집" 명령 그룹의 일부입니다.
옵션
입력 섹션에 있어야 합니다.
-순서 순서
필수 섹션에 있어야 합니다.
-지역 범위
마스크할 영역. 영역 세트는 위치 쌍 세트로 지정됩니다. NS
위치는 정수입니다. 숫자가 아닌 알파벳이 아닌 문자로 구분됩니다.
지역 사양의 예: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
추가 섹션에 있어야 합니다.
-낮추다 비녀장
시퀀스 문자를 소문자로 변환하여 영역을 '마스킹'할 수 있습니다.
비엠보스 프로그램(예: fasta)은 이것을 마스크 영역으로 해석할 수 있습니다. 순서는
케이스 변경 외에는 변경되지 않습니다. 전체 시퀀스가
다음을 사용하여 지정된 영역을 소문자로 마스킹하기 전에 대문자입니다.
'-만찬' 플래그. 기본값: N
-마스크 문자 현
마스킹할 때 사용할 문자입니다. 기본값은 단백질 서열의 경우 'X', 핵산의 경우 'N'입니다.
시퀀스. 마스크 문자가 SPACE 문자 또는 null 문자로 설정된 경우,
그런 다음 시퀀스는 소문자로 변경하여 '마스킹'됩니다.
'-소문자' 플래그. 기본값: @($(acdprotein)?X:N)
산출 섹션에 있어야 합니다.
- outseq 분리
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 maskeqe 사용