AlphaFold 3라는 이름의 Linux 앱으로, 최신 버전은 AlphaFoldv3.0.1sourcecode.tar.gz 형식으로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
AlphaFold 3 with OnWorks라는 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행해보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린샷:
알파폴드 3
설명 :
Google DeepMind에서 개발한 AlphaFold 3는 생체 분자 구조와 상호작용을 탁월한 정확도로 예측하는 고급 딥러닝 시스템입니다. 이 저장소는 AlphaFold 3 실행을 위한 완전한 추론 파이프라인을 제공하지만, 모델 매개변수에 대한 접근은 제한되어 있으며 특정 이용 약관에 따라 Google에서 직접 제공받아야 합니다. 이 시스템은 구조 생물학, 생화학, 생물정보학 분야의 과학 연구 응용 분야에 적합하도록 설계되어 단백질, 리간드, 공유 결합 변형의 정확한 모델링을 지원합니다. 사용자는 Docker 컨테이너를 통해 로컬 예측을 수행할 수 있으며, AlphaFold 3의 추론 프로세스를 제공된 JSON 입력 구성과 통합할 수 있습니다. 이 소프트웨어는 데이터 전처리 및 GPU 가속 추론을 모두 실행할 수 있는 유연한 옵션을 제공하여 사용자가 사용 가능한 컴퓨팅 리소스에 맞춰 조정할 수 있도록 지원합니다.
기능
- 구조 예측을 위한 AlphaFold 3의 전체 추론 파이프라인을 구현합니다.
- CPU 기반 데이터 전처리 및 GPU 가속 추론 모드를 지원합니다.
- 간소화된 배포 및 재현성을 위한 Docker 기반 환경
- 사용자 정의 가능한 예측 작업을 위한 JSON 기반 입력 구성
- 생체 분자 구조 및 상호 작용 모델링을 위해 설계되었습니다.
- 설치, 입출력 형식 및 알려진 문제에 대한 광범위한 설명서
프로그래밍 언어
C++, 파이썬
카테고리
이 애플리케이션은 https://sourceforge.net/projects/alphafold-3.mirror/에서도 다운로드할 수 있습니다. OnWorks에 호스팅되어 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉽게 온라인에서 실행할 수 있도록 설계되었습니다.