이것은 최신 릴리스가 MetaWatt-3.5.3.zip으로 다운로드될 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 metawatt라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
무료로 OnWorks와 함께 Linux에서 실행하려면 metawatt라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린샷:
Linux 온라인에서 실행되는 메타와트
설명 :
Metawatt 비너는 테트라뉴클레오티드 빈도 및 차등 적용 범위 기반 비닝의 다변수 통계를 사용하는 그래픽 비닝 도구입니다. 또한 비닝 품질의 분류학적 평가를 수행합니다(다이아몬드 BLASTx를 통해). 생성된 저장소는 fasta로 편집하고 내보낼 수 있습니다. Metawatt는 Java SWING으로 구현되며 SVG 그래픽 내보내기를 위해 Diamond, HMMer3.1, BBMap, Prodigal 및 Batik 라이브러리에 최소한으로 의존합니다.인용: Strous M, Kraft B, Bisdorf R, TegetMeyer H(2012) 혼합 배양의 미생물 생리학을 위한 메타게놈 콘티그의 비닝. 미생물 생리학과 신진대사 3:410의 국경. 도이: 10.3389/fmicb.2012.00410
기능
- 결합된 테트라뉴클레오티드 및 메타게놈 콘티그의 차등 적용 범위 비닝
- 데이터 탐색을 위한 그래픽 사용자 인터페이스
- Diamond blastp를 사용한 Bin의 분류학적 프로파일링
- 보존된 단일 카피 유전자의 검출
- 보존된 유전자를 기반으로 한 빈의 계통 발생 트리
- 대화형 GC/커버리지 또는 커버리지/커버리지 플롯
- 또한 명령줄에서 완전히 자동으로 실행됩니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
자바 스윙
프로그래밍 언어
자바
이것은 https://sourceforge.net/projects/metawatt/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.