이것은 최신 릴리스를 ptesfinder_v1.tar.gz로 다운로드할 수 있는 PTESFinder라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks가 포함된 PTESFinder라는 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
PTESFinder
설명 :
PTESFinder는 처리량이 많은 RNAseq 데이터에서 전사 후 엑손 셔플링 이벤트를 식별하기 위한 계산 파이프라인입니다. PTESFinder는 확립된 RNASeq 도구의 성능을 활용하고 이러한 잘못된 긍정을 특별히 표적으로 삼도록 설계된 엄격한 필터를 적용하여 알려진 모든 종류의 잘못된 긍정 구조를 체계적으로 제외합니다. PTESFinder는 추정 PTES 구조에 매핑된 읽기의 정렬 품질을 게놈 영역 및 표준적으로 접합된 전사본에 매핑되었을 때 동일한 읽기의 품질과 비교합니다. 이 접근 방식은 PTES 지원 읽기에 대한 신뢰도를 높입니다. 템플릿 전환 이벤트에서 발생하는 읽기는 전사체에 정렬될 때 큰 삽입 삭제가 특징인 경우가 많습니다. PTESFinder는 추가 필터를 사용하여 PTES 엑손-엑손 접합 주위에 모호한 정렬이 있는 읽기를 제외하고 이러한 지원 읽기에 대한 신뢰도를 더욱 높입니다. PTESFinder는 높은 특이성을 유지하면서 다른 발표된 방법보다 더 많은 PTES 구조를 식별합니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
유닉스 쉘, 자바
카테고리
이는 https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 시스템 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.