이것은 QUASR_v6.08.tar로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 QUASR이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks가 포함된 QUASR이라는 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행해 보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린샷:
콰스르
설명 :
QUASR은 Illumina, 454 및 Ion Torrent 플랫폼의 차세대 시퀀싱(NGS) 데이터를 처리하고 분석하기 위해 작성된 경량 파이프라인입니다. 원래는 바이러스 데이터용으로 작성되었지만 모든 NGS 데이터 세트에서 작업할 수 있을 만큼 일반적입니다. 기능은 다음과 같습니다:
중복 제거
역다중화
프라이머 제거
품질 보증(QA) 그래프 작성
품질 관리(QC)
합의 생성
소수 변형 결정
소수 변형 그래프
주요 현재 버전은 Python6으로 작성된 3.X입니다. 7.X는 Java로 다시 작성한 것이지만 아직 작업이 진행 중입니다. 둘 다 최대한 가볍게 작성되어 데스크톱이나 노트북은 물론 컴퓨팅 클러스터에서도 최소한의 메모리 요구 사항으로 실행할 수 있습니다.
QUASR에 문제가 있는 경우 README에 제공된 이메일 주소로 저에게 연락해 주십시오.
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
Python
카테고리
이는 https://sourceforge.net/projects/quasr/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 시스템 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.