이것은 NGSEP라는 이름의 Windows 앱으로, 최신 릴리스는 NGSEPwindows_4.1.0.zip으로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 NGSEP라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 모든 OS OnWorks 온라인 에뮬레이터를 시작하지만 더 나은 Windows 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Windows OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 애플리케이션을 다운로드하여 설치합니다.
- 7. Linux 배포 소프트웨어 저장소에서 Wine을 다운로드합니다. 설치가 완료되면 앱을 두 번 클릭하여 Wine과 함께 실행할 수 있습니다. 인기 있는 Windows 프로그램 및 게임을 설치하는 데 도움이 되는 Wine을 통한 멋진 인터페이스인 PlayOnLinux를 사용해 볼 수도 있습니다.
Wine은 Linux에서 Windows 소프트웨어를 실행하는 방법이지만 Windows가 필요하지 않습니다. Wine은 모든 Linux 데스크탑에서 직접 Windows 프로그램을 실행할 수 있는 오픈 소스 Windows 호환성 계층입니다. 본질적으로 Wine은 Windows가 필요하지 않고 모든 Windows 응용 프로그램을 실행할 수 있도록 Windows를 처음부터 충분히 다시 구현하려고 합니다.
스크린샷:
NGSEP
설명 :
NGSEP는 DNA 고처리량 시퀀싱 데이터 분석을 위한 통합 프레임워크입니다. NGSEP의 주요 용도는 게놈 변이의 대규모 데이터 세트의 구성 및 다운스트림 분석입니다. NGSEP는 단일 뉴클레오티드 변이체(SNV), 소형 및 대형 삽입결실, 짧은 직렬 반복(STR), 역전 및 CNV(복사 수 변이체)의 정확한 검출 및 유전형 분석을 수행합니다. NGSEP는 또한 기능 주석, 필터링, 형식 변환, 비교, 클러스터링, 대치, 침입 분석 및 다양한 종류의 통계를 위한 모듈을 제공합니다. 전체 기능 목록은 Wiki(https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
뉴스: 우리는 새로운 de-novo 게놈 어셈블러의 첫 번째 버전을 사용할 수 있게 되었습니다. 자세한 내용은 위키에서 확인할 수 있습니다.
특징
- De-novo 게놈 어셈블리
- 참조 게놈에 대한 원시 읽기 정렬
- SNP, CNV 및 구조적 변이체 감지
- VCF 조작: 기능 주석, 병합, 필터, 비교, 형식 변환, 대치
- 역다중화 읽기
- 주석이 달린 게놈 어셈블리의 정렬
- GFF3 형식의 transcriptome anptations에 대한 통계 및 필터링
오디언스 (Audience)
의료 산업, 과학/연구, 기타 대상, 농업
사용자 인터페이스
자바 SWT, 콘솔/터미널, 이클립스
프로그래밍 언어
자바
이것은 https://sourceforge.net/projects/ngsep/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.