ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ autodock4 ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
autodock - docking ຂອງ ligands ເຄມີກັບ receptors ທາດໂປຼຕີນ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
autodock4 [ທາງເລືອກໃນການ]
ລາຍລະອຽດ
AutoDock ປະຕິບັດການຈອດອັດຕະໂນມັດຂອງທາດປະສົມເຄມີກັບທາດໂປຼຕີນ, ie ມັນຄາດຄະເນ.
ໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍແນວໃດ, ເຊັ່ນ: ທາດຍ່ອຍ ຫຼືຕົວບັນຈຸຢາ, ຜູກມັດກັບຕົວຮັບຂອງ 3D ທີ່ຮູ້ຈັກ.
ໂຄງສ້າງ.
AutoDockSuite ປະກອບດ້ວຍສອງໂຄງການຕົ້ນຕໍທີ່ AutoDock ດໍາເນີນການ docking ຂອງ
ligand ກັບຊຸດຂອງຕາຂ່າຍໄຟຟ້າທີ່ອະທິບາຍໂປຣຕີນເປົ້າຫມາຍແລະ AutoGrid ລ່ວງຫນ້າ
ຕາຂ່າຍໄຟຟ້າເຫຼົ່ານີ້.
OPTIONS
-p parameter_filename
-l log_filename
-o ໃຊ້ຮູບແບບ PDBQ ເກົ່າ, ຄິດຄ່າ q ໃນຖັນ 55-61
-k ຮັກສາຕົວເລກທີ່ຕົກຄ້າງຕົ້ນສະບັບ
-i ບໍ່ສົນໃຈ header-checking
-t ວິເຄາະໄຟລ໌ PDBQ ເພື່ອກວດສອບການບິດ, ຈາກນັ້ນຢຸດ.
-c < command_file ຮູບແບບຄໍາສັ່ງ, ໂດຍໄຟລ໌
-c | control_program ຮູບແບບຄໍາສັ່ງ, ໂດຍ control_program
EXAMPLE
ໃນ Debian, ໄດເລກະທໍລີ /usr/share/doc/autodock ສະເຫນີຕົວຢ່າງທີ່ຈະດໍາເນີນການ. ປ່ຽນແປງເປັນສິ່ງນັ້ນ
directory ແລະ unpack (ເປັນ root) ໄຟລ໌ແຜນທີ່ gzipped, ຫຼັງຈາກນັ້ນດໍາເນີນການ AutoDock ດັ່ງທີ່ສະແດງ
ຂ້າງລຸ່ມນີ້:
gunzip *.map.gz
autodock4 -p 1pgp.dpf -l /tmp/1pgp.dlg
ການຕີຄວາມໝາຍຂອງຜົນໄດ້ຮັບແມ່ນຊ່ວຍເຫຼືອໂດຍຊຸດ AutoDockTools. ກະລຸນາກວດກາຍັງ
ບົດຮຽນທີ່ສະເຫນີອອນໄລນ໌.
ໃຊ້ autodock4 ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net