ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ DBdust ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
DBdust - ລາຍລະອຽດ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
DBdust [-b] [-wint(64)] [-tສອງ (2.)] [-mint(10)] ເສັ້ນທາງ:db|ເຂື່ອນ
ລາຍລະອຽດ
ແລ່ນສູດການຄິດໄລ່ DUST symmetric ໃນໄລຍະທີ່ອ່ານຢູ່ໃນ DB ທີ່ບໍ່ມີການຕັດ ເສັ້ນທາງ.db ຫຼື ເສັ້ນທາງ.ເຂື່ອນ
ການຜະລິດຕິດຕາມ.ເສັ້ນທາງ.dust[.anno,.data] ທີ່ໝາຍເຖິງຊ່ວງເວລາທັງໝົດຂອງຄວາມຊັບຊ້ອນຕໍ່າ
ລໍາດັບ, ບ່ອນທີ່ປ່ອງຢ້ຽມສະແກນມີຂະຫນາດ -w, ຂອບເຂດສໍາລັບການເປັນຄວາມຊັບຊ້ອນຕ່ໍາ
ໄລຍະຫ່າງແມ່ນ -t, ແລະພຽງແຕ່ໄລຍະທີ່ສົມບູນແບບຂອງຂະຫນາດຫຼາຍກ່ວາ -m ຖືກບັນທຶກ. ຖ້າ
-b ທາງເລືອກແມ່ນຖືກກໍານົດຫຼັງຈາກນັ້ນຄໍານິຍາມຂອງຄວາມສັບສົນຕ່ໍາໃຊ້ເວລາເຂົ້າໄປໃນບັນຊີຄວາມຖີ່ຂອງ
ພື້ນຖານທີ່ໃຫ້ໄວ້. ຄໍາສັ່ງແມ່ນເພີ່ມຂຶ້ນຖ້າຫາກວ່າໃຫ້ DB ທີ່ຂໍ້ມູນໃຫມ່ໄດ້ຖືກເພີ່ມ
ນັບຕັ້ງແຕ່ມັນໄດ້ດໍາເນີນການຄັ້ງສຸດທ້າຍໃນ DB, ຫຼັງຈາກນັ້ນມັນຈະຂະຫຍາຍການຕິດຕາມເພື່ອປະກອບມີການອ່ານໃຫມ່.
ມັນເປັນສິ່ງສໍາຄັນທີ່ຈະກໍານົດທຸງນີ້ສໍາລັບ genomes ທີ່ມີອະຄະຕິ AT / GC ທີ່ເຂັ້ມແຂງ, ເຖິງແມ່ນວ່າລະຫັດແມ່ນ.
ຊ້າລົງໜ້ອຍນຶ່ງ. ການຕິດຕາມຂີ້ຝຸ່ນ, ຖ້າມີ, ແມ່ນເຂົ້າໃຈແລະໃຊ້ໂດຍ DBshow(1)
DBstats(1) ແລະ daligner(1).
DBdust ຍັງສາມາດດໍາເນີນການຜ່ານທາງຕັນ DB untriimmed ໃນກໍລະນີທີ່ມັນ outputs ຕິດຕາມ
ການເຂົ້າລະຫັດບ່ອນທີ່ຊື່ໄຟລ໌ຕິດຕາມມີໝາຍເລກບລັອກ, ເຊັ່ນ: .FOO.3.dust.anno ແລະ
.FOO.3.dust.data, ໃຫ້ FOO.3 ຢູ່ໃນເສັ້ນຄໍາສັ່ງ. ພວກເຮົາໂທຫານີ້ a block ຕິດຕາມ. ນີ້
ອະນຸຍາດໃຫ້ການຂະຫນານວຽກເຮັດງານທໍາໃນ chunks ຂະຫນາດຕັນ, ແລະລໍາດັບຜົນຂອງການຕິດຕາມຕັນ
ຫຼັງຈາກນັ້ນສາມາດຖືກລວມເຂົ້າໃນການຕິດຕາມສໍາລັບ DB untrimmed ທັງຫມົດກັບ Catrack.
ໃຊ້ DBdust ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net