ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ fahash ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
fahash - sequence hash builder for reverse e-PCR
ສະຫຼຸບສັງລວມ
fahash [-hV] -b hash-file [-w wdsize] [-f ໄລຍະເວລາ] [-F fragment_min, fragment_max] [-k] [-c
cacheize] [-v 1|2] famap-file ...
fahash [-hV] -T hash-file [-o outfile]
ລາຍລະອຽດ
ໂຄງການ ຟາຊ ແມ່ນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງຊຸດ e-PCR ແລະຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອສ້າງໄຟລ໌ hash, ແລະຜົນຜະລິດ
ສະຖິຕິການໃຊ້ຄໍາສໍາລັບການຄົ້ນຫາ e-PCR ປີ້ນກັບກັນ.
OPTIONS
-b hash-file
ສ້າງຕາຕະລາງ hash (hash-file) ຈາກໄຟລ໌ລໍາດັບ,
-T hash-file
ພິມສະຖິຕິການໃຊ້ຄໍາສໍາລັບ hash-file
-o outfile
ຂຽນຜົນໄດ້ຮັບໃສ່ໄຟລ໌ 'outfile'
ທາງເລືອກໃນການກໍ່ສ້າງ:
-w ຂະຫນາດຄໍາສັບ
ກໍານົດຂະຫນາດຄໍາໃນເວລາທີ່ສ້າງຕາຕະລາງ hash
-f ໄລຍະເວລາ
ກໍານົດຄວາມບໍ່ສອດຄ່ອງໃນເວລາທີ່ການສ້າງຕາຕະລາງ hash
-k ຂ້າມການຊໍ້າຄືນເມື່ອສ້າງໄຟລ໌ hash
-F ຕ່ຳສຸດ, ສູງສຸດທີ່ເຄຍ
ກໍານົດ watermarks ສໍາລັບຂະຫນາດ fragment (ໃນ Mb) (ສະບັບ 1 ເທົ່ານັ້ນ)
-c cacheize
ກໍານົດຂະຫນາດແຄດ (ຮຸ່ນ 2 ເທົ່ານັ້ນ)
-v ver ໃຊ້ຮູບແບບ (1|2, 2 ແມ່ນຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ)
EXAMPLE
famap -tN -b genome.famap org/chr_*.fa
fahash -b genome.hash -w 12 -f3 ${PWD}/genome.famap
re-PCR -s genome.hash -n1 -g1 ACTATTGATGATGA AGGTAGATGTTTTT 120-200
ເບິ່ງ ຊື່ສຽງ(1) ແລະ re-pcr(1)
ໃຊ້ fahash ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net