ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ fastatool ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
fastatool - ສະຫນອງໃຫ້ a ທີ່ກໍານົດໄວ້ of ເຄື່ອງມື ທີ່ເປັນປະໂຫຍດ ໃນເວລາທີ່ ການເຮັດວຽກ ກັບ FASTA ໄຟລ໌.
ລາຍລະອຽດ
ໂຄງການນີ້ແມ່ນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງຊຸດປະກອບ MIRA. Fastatool ສະຫນອງຊຸດຂອງເຄື່ອງມື
ເປັນປະໂຫຍດໃນເວລາທີ່ເຮັດວຽກກັບໄຟລ໌ຕິດຕາມ FASTA.
ກະລຸນາກວດເບິ່ງເອກະສານຂ້າງລຸ່ມນີ້ສໍາລັບລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມ.
ເລື່ອງຫຍໍ້"
fastatool <ເຄື່ອງມື ພາລາມິເຕີ>
OPTIONS
clip clips ອີງໃສ່ຊ້າຍແລະຂວາຂອງລໍາດັບ FASTA, ຂຽນຜົນໄດ້ຮັບເປັນ STDOUT.
ການນໍາໃຊ້:
clipFASTA -l ຄລິບຊ້າຍ -r ຄລິບຂວາ fastainfile
ອະນາໄມ
ລຶບລໍາດັບທີ່ມີຖານທີ່ບໍ່ແມ່ນ IUPAC ຫຼືລໍາດັບຫວ່າງເປົ່າຈາກໄຟລ໌ FASTA, ຂຽນ
ລໍາດັບ 'ຢູ່ລອດ' ໄປຫາໄຟລ໌ໃຫມ່. ຖ້າໄຟລ໌ທີ່ມີຄຸນນະພາບຖືກມອບໃຫ້, ເຮັດຄວາມສະອາດ
ສະບັບຂອງທີ່ຍັງຂຽນ. ລໍາດັບໃນໄຟລ໌ທີ່ມີຄຸນນະພາບ (ຖ້າໃຫ້)
ຕ້ອງຢູ່ໃນລໍາດັບດຽວກັນກ່ວາຢູ່ໃນໄຟລ໌ fasta.
ການນໍາໃຊ້:
sanitizeFASTA fastainfile fastaoutfile [fastaqualin fastaqualoutfile]
ໃຊ້ fastatool ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net