gt-uniq - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

gt-uniq - ກັ່ນ​ຕອງ​ອອກ​ຂໍ້​ກໍາ​ນົດ​ຂໍ້​ຄຸນ​ນະ​ສົມ​ບັດ​ຊ​້​ໍ​າ​ໃນ​ໄຟລ​໌ GFF3 ຈັດ​ລຽງ​ລໍາ​ດັບ​.

ສະຫຼຸບສັງລວມ

gt ເປັນເອກະລັກ [ທາງເລືອກ ...] [GFF3_file]

ລາຍລະອຽດ

-v [ແມ່ນ|ບໍ່]
be verbose (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-o [ຊື່​ເອ​ກະ​ສານ]
ປ່ຽນເສັ້ນທາງຜົນຜະລິດໄປຫາໄຟລ໌ທີ່ລະບຸ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ)

-gzip [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຂຽນ gzip ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ຖືກບີບອັດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-bzip2 [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຂຽນໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ຖືກບີບອັດ bzip2 (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

- ຜົນບັງຄັບໃຊ້ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ບັງຄັບໃຫ້ຂຽນເປັນໄຟລ໌ອອກ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-ຊ່ວຍ
ສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອແລະອອກ

-ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງຂໍ້ມູນສະບັບແລະອອກ

ໄລຍະຂ້າມຄວາມເລິກທຳອິດຂອງກຣາບຟີເຈີ node ເລີ່ມຕົ້ນຢູ່ທີ່ຈຸດຄຸນສົມບັດລະດັບສູງສຸດ (ຫຼື
pseudo-node) ແລະສຳຫຼວດໃຫ້ໄກຕາມແຕ່ລະສາຂາເທົ່າທີ່ເປັນໄປໄດ້ກ່ອນທີ່ຈະຕິດຕາມ. ໃຫ້
ສົມ​ມຸດ​ວ່າ​ຂໍ້​ຄຸນ​ສົມ​ບັດ​ໄດ້​ຖືກ​ເກັບ​ຮັກ​ສາ​ໄວ້​ໃນ​ບັນ​ຊີ​ລາຍ​ການ​ຕາມ​ລໍາ​ດັບ​ຂອງ​ການ​ຜ່ານ​ຂອງ​ເຂົາ​ເຈົ້າ (ເອີ້ນ​ວ່າ​
"ບັນຊີລາຍຊື່ node ຄຸນນະສົມບັດ").

ກຣາຟ node ຄຸນສົມບັດສອງອັນຖືກພິຈາລະນາວ່າຈະຖືກຊ້ໍາອີກຖ້າຫາກວ່າບັນຊີລາຍຊື່ node ຄຸນນະສົມບັດຂອງເຂົາເຈົ້າ (ຈາກ
depth-first traversal) ມີຄວາມຍາວດຽວກັນ ແລະແຕ່ລະຄູ່ node ຄຸນສົມບັດ (ຈາກທັງສອງລາຍການຢູ່ທີ່
ຕໍາແຫນ່ງດຽວກັນ) ແມ່ນ "ຄ້າຍຄືກັນ".

ສອງໂຫນດຄຸນສົມບັດແມ່ນ "ຄ້າຍຄືກັນ", ຖ້າພວກເຂົາມີ ID ລໍາດັບດຽວກັນ, ປະເພດຄຸນສົມບັດ, ຊ່ວງ,
strand, ແລະໄລຍະ.

ສໍາ​ລັບ​ການ​ດັ່ງ​ກ່າວ​ຊ​້​ໍ​າ node ເສັ້ນ​ສະ​ແດງ​ໃຫ້​ເຫັນ​ຫນຶ່ງ​ທີ່​ມີ​ຄະ​ແນນ​ສູງ​ກວ່າ (ຂອງ​ລະ​ດັບ​ສູງ​ສຸດ​
ຄຸນ​ນະ​ສົມ​ບັດ​) ຖືກ​ເກັບ​ຮັກ​ສາ​ໄວ້​. ຖ້າພຽງແຕ່ຫນຶ່ງຂອງກາຟ node ຄຸນນະສົມບັດມີຄະແນນທີ່ກໍານົດໄວ້, ອັນນີ້ແມ່ນ
ເກັບຮັກສາໄວ້.

ການລາຍງານ ບັກ

ລາຍງານບັກຫາgt-users@genometools.org>.

ໃຊ້ gt-uniq ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net