ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ indelible ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
indelible - simulator ມີອໍານາດແລະປ່ຽນແປງຂອງວິວັດທະນາການທາງຊີວະພາບ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ຍົກເລີກບໍ່ໄດ້
ບໍ່ມີທາງເລືອກທີ່ສາມາດຜ່ານເສັ້ນຄໍາສັ່ງ.
ລາຍລະອຽດ
ຍົກເລີກບໍ່ໄດ້ ສາມາດຈໍາລອງວິວັດທະນາການຂອງ nucleotide ຫຼາຍພາທິຊັນ, ອາຊິດ amino, ຫຼື codon.
ຊຸດຂໍ້ມູນຜ່ານຂະບວນການແຊກ, ລຶບ, ແລະການທົດແທນຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ
ເວລາ. ຮູບແບບວິວັດທະນາການທົ່ວໄປທັງໝົດແມ່ນໄດ້ຮັບການສະໜັບສະໜູນ.
ເອກະສານສະບັບເຕັມສໍາລັບ ຍົກເລີກບໍ່ໄດ້ ສາມາດໃຊ້ໄດ້ພາຍໃຕ້
/usr/share/doc/indelible/help/index.html.
CONFIGURATION
ຍົກເລີກບໍ່ໄດ້ ອ່ານການຕັ້ງຄ່າສໍາລັບການຈໍາລອງແລ່ນຈາກໄຟລ໌ທີ່ມີຊື່ control.txt ໃນ
ໄດເລກະທໍລີປະຈຸບັນ. ໄຟລ໌ໄດ້ຖືກແບ່ງອອກເປັນທ່ອນໄມ້, ໂດຍແຕ່ລະບລັອກຄວບຄຸມຫນຶ່ງ
ລັກສະນະສະເພາະຂອງການຈໍາລອງ. Blocks ອາດຈະປະກອບມີບລັອກຍ່ອຍເພີ່ມເຕີມ. ຄໍາເຫັນສາມາດ
ໃຫ້ຢູ່ໃນຮູບແບບ C ຫຼື C ++. ຖ້າ ຍົກເລີກບໍ່ໄດ້ ຖືກປະຕິບັດໂດຍບໍ່ມີໄຟລ໌ຄວບຄຸມປະຈຸບັນ, ເປັນ
ໄຟລ໌ຕົວຢ່າງແມ່ນຖືກສ້າງຂຶ້ນ.
[ປະເພດ] ປະເພດ
ທຸກໆໄຟລ໌ຄວບຄຸມຕ້ອງເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍ a TYPE ຕັນ. ປະເພດທີ່ເປັນໄປໄດ້ແມ່ນ ນິວເຄລຍ,
AMINOACID, ແລະ ໂຄໂດນ.
[ການຕັ້ງຄ່າ]
ຕັນນີ້ກໍານົດຄວາມມັກຂອງຜູ້ໃຊ້ທີ່ບໍ່ຈໍາເປັນເຊັ່ນ: ປະເພດໄຟລ໌ຜົນຜະລິດແລະ
ຮູບແບບ, ເມັດສໍາລັບການຜະລິດຈໍານວນສຸ່ມ, ແລະວ່າຈະໃຫ້ໄດ້ຮັບການລາຍລະອຽດ
ບົດລາຍງານ.
[ໂມເດວ] ຊື່ຕົວແບບ
ຕັນນີ້ເລີ່ມຕົ້ນຮູບແບບວິວັດທະນາການໃຫມ່ເພື່ອໃຊ້ສໍາລັບການຈໍາລອງ. ໄດ້
ຕົວກໍານົດການໂດຍສະເພາະລວມທັງແບບຈໍາລອງການທົດແທນ, ອັດຕາ indel ແລະ codon-site
ແບບຈໍາລອງຖືກຄວບຄຸມຜ່ານຕົວແບບຍ່ອຍ. ຊື່ຕົວແບບ ສາມາດເປັນຊື່ໃດກໍໄດ້ທີ່ທ່ານເລືອກ.
[ຕົ້ນໄມ້] ຊື່ຕົ້ນໄມ້ໃຫມ່
ບລັອກນີ້ແມ່ນໃຊ້ເພື່ອລະບຸຕົ້ນໄມ້ແນະນຳທີ່ມີຊື່ໃຫ້ ຊື່ຕົ້ນໄມ້.
ໄລ ຍະ ຫ່າງ evolutionary ແມ່ນ ເປັນ ຕົວ ແທນ ເປັນ ຄວາມ ຍາວ ສາ ຂາ ສໍາ ລັບ ຕົ້ນ ໄມ້ ໃນ NEWICK
ຮູບແບບ.
[ສາຂາ]
ຕັນເຫຼົ່ານີ້ຖືກໃຊ້ເພື່ອຈໍາລອງຂະບວນການທີ່ບໍ່ຢູ່ສະຫມໍ່າສະເຫມີແລະບໍ່ເປັນເອກະພາບ.
ແບບຈໍາລອງທີ່ແຕກຕ່າງກັນສາມາດໄດ້ຮັບການກໍານົດກ່ຽວກັບສາຂາທີ່ແຕກຕ່າງກັນຂອງຄໍາແນະນໍາ - ຕົ້ນໄມ້ອະນຸຍາດໃຫ້
ສາຂາທີ່ຈະມີຮູບແບບທີ່ແຕກຕ່າງກັນຂອງການທົດແທນ, ການແຜ່ກະຈາຍຄວາມຍາວ indel, ອັດຕາ
heterogeneity, ອົງປະກອບພື້ນຖານແລະອື່ນໆ.
[PARTITIONS] ຊື່ພາທິຊັນ
ໃນລະຫວ່າງການດໍາເນີນການແຕ່ລະພາກສ່ວນລໍາດັບຫຼາຍສາມາດຈໍາລອງໄດ້. ສໍາລັບການແບ່ງປັນແຕ່ລະຄົນ
ຈະຕ້ອງລະບຸຮູບແບບການວິວັດທະນາການ ແລະ ຄວາມຍາວຂອງລຳດັບ.
[ວິວັດທະນາການ]
ພາຍໃນບລັອກນີ້, ການຈໍາລອງຫຼາຍອັນຂອງພາທິຊັນອາດຈະຖືກສ້າງຂື້ນ.
COPYRIGHT
ສະຫງວນລິຂະສິດ © 2010 William Fletcher License GPLv3+: GNU GPL version 3 ຫຼືຫຼັງຈາກນັ້ນ.
ນີ້ແມ່ນຊອບແວຟຣີ: ທ່ານມີອິດສະຫຼະໃນການປ່ຽນແປງແລະແຈກຢາຍມັນ. ບໍ່ມີການຮັບປະກັນ,
ໃນຂອບເຂດທີ່ກົດໝາຍອະນຸຍາດ. ຂໍ້ຄວາມໃບອະນຸຍາດເຕັມແມ່ນມີຢູ່
<http://gnu.org/licenses/gpl.html>.
ການຮັບຮູ້
William Fletcher ແລະ Ziheng Yang (2009). INDELible: A Simulator ປ່ຽນແປງໄດ້ຂອງຊີວະສາດ
ລຳດັບວິວັດທະນາການ, ໂມເລກຸນ ຊີວະສາດ ແລະ ວິວັດທະນາການ, 26(8): 1879-1888.
ໃຊ້ອອນໄລນ໌ທີ່ບໍ່ສາມາດລຶບໄດ້ໂດຍການໃຊ້ບໍລິການ onworks.net