ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ ltrsift ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຟຣີຫຼາຍອັນຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
ltrsift - ການໂຕ້ຕອບຮູບພາບສໍາລັບການ postprocessing ແລະການຈັດປະເພດຂອງ LTR
ຜູ້ສະຫມັກ retrotransposon
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ltrsift
ລາຍລະອຽດ
LTRsift ເປັນເຄື່ອງມືເດັສທັອບແບບກາຟິກສຳລັບການປະມວນຜົນແບບເຄິ່ງອັດຕະໂນມັດຂອງ de novo ທີ່ຄາດຄະເນໄວ້
ຄໍາບັນຍາຍ LTR retrotransposon, ເຊັ່ນ: ອັນທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍ LTRharvest ແລະ LTRdigest.
CONFIGURATION
ຄູ່ສຸດທ້າຍ (lastal ແລະ lastdb) ຄວນຢູ່ໃນເສັ້ນທາງຄົ້ນຫາລະບົບ. ຖ້າພວກເຂົາ
ບໍ່ແມ່ນ, ມັນເປັນໄປໄດ້ທີ່ຈະລະບຸສະຖານທີ່ຂອງພວກເຂົາໂດຍໃຊ້ສະພາບແວດລ້ອມ "GT_LAST_PATH".
ຕົວປ່ຽນແປງກ່ອນທີ່ຈະແລ່ນ LTRsift. ດຽວກັນໃຊ້ກັບສະຖານທີ່ BLAST. ໃຊ້
``GT_BLAST_PATH” ເພື່ອລະບຸເສັ້ນທາງເຕັມໄປຫາ “blastall” ທີ່ສາມາດປະຕິບັດໄດ້.
ໄຟລ໌ຮູບແບບ (ອະທິບາຍວ່າແຜນວາດເສັ້ນຊື່ຂອງຄຸນສົມບັດຂອງຜູ້ສະໝັກ) ເປັນໄປໄດ້ແນວໃດ
ຕັ້ງຜ່ານຕົວແປສະພາບແວດລ້ອມ LTRSIFT_STYLE_FILE. ຮູບແບບເລີ່ມຕົ້ນທີ່ເຂົ້າໃຈໄດ້ຖືກສ້າງຂຶ້ນ
ເຂົ້າໄປໃນ LTRsift.
ໃຊ້ ltrsift ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net