ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ pymvpa2-ofmotionqc ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
pymvpa2-ofmotionqc - BOLD fMRI motion QC plot ສໍາລັບຊຸດຂໍ້ມູນ OpenFMRI
ສະຫຼຸບສັງລວມ
pymvpa2 ofmotionqc [- ການປ່ຽນແປງ] [-h] --ເສັ້ນທາງ PATH [-t ID] [--estimate-fname NAME]
[--ພີ່ນ້ອງ REF REF] [--exclude-subjs ID [ID ...]] [--estimate-order LABEL] [--rad2deg]
[--outlier-minthresh OUTLIER_MINTHRESH] [--outlier-stdthresh OUTLIER_STDTHRESH] [--savefig
ບັນທຶກ]
ລາຍລະອຽດ
ສ້າງແຜນການ QC ສໍາລັບການຄາດຄະເນການເຄື່ອນໄຫວ BOLD fMRI ຈາກຊຸດຂໍ້ມູນ OpenFMRI.
ຕົວເລກທີ່ສ້າງຂຶ້ນປະກອບດ້ວຍສອງຕອນຍ່ອຍ: ຫນຶ່ງສໍາລັບການແປແລະຫນຶ່ງສໍາລັບການຫມຸນ.
L2-norm ສໍາລັບແຕ່ລະປະເພດການເຄື່ອນໄຫວແມ່ນວາງແຜນໄວ້. ຂອບເຂດການແລ່ນແມ່ນສະແດງດ້ວຍເຄື່ອງໝາຍຈຸດ
ເສັ້ນຕັ້ງ. ສະຖິຕິຕໍ່ໄປນີ້ແມ່ນເປັນພາບ
1. ໄລຍະຂ້າມຫົວຂໍ້ (ຂັ້ນຕ່ຳ, ສູງສຸດ) ດ້ວຍພື້ນທີ່ຮົ່ມສີເທົາອ່ອນ
2. 50% ເປີເຊັນປະມານສະເລ່ຍທີ່ມີພື້ນທີ່ຮົ່ມສີຂີ້ເຖົ່າປານກາງ
3. ຄວາມຜິດພາດມາດຕະຖານຂອງຄ່າສະເລ່ຍ (SEM; +/-) ທີ່ມີພື້ນທີ່ຮົ່ມສີຂີ້ເຖົ່າເຂັ້ມ
4. ປານກາງໃນທົ່ວວິຊາທີ່ມີເສັ້ນສີດໍາ
5. ວິຊາທີ່ນອກເໜືອກວ່າແມ່ນສະແດງເປັນເສັ້ນສີແດງສ່ວນບຸກຄົນ
Outliers ຖືກກໍານົດເປັນວິຊາທີ່ເກີນຂອບເຂດທຸກບ່ອນພາຍໃນໄລຍະທີ່ກໍານົດ. ໃນ
ກໍລະນີທີ່ຊຸດເວລາການເຄື່ອນໄຫວທັງໝົດສຳລັບການແລ່ນນັ້ນຖືກວາງແຜນເປັນຕົວນອກ. IDs ສໍາລັບ
outliers ທີ່ກວດພົບແມ່ນພິມໃສ່ console. ໃຫ້ສັງເກດວ່າ ID ເຫຼົ່ານີ້ບໍ່ໄດ້ບັນຊີສໍາລັບ
ຂໍ້ມູນທີ່ຂາດຫາຍໄປຫຼືຫົວຂໍ້ທີ່ຖືກຍົກເວັ້ນ. ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ໃນກໍລະນີທີ່ບໍ່ມີຂໍ້ມູນຂາດຫາຍໄປແລະບໍ່ມີການຍົກເວັ້ນ
ວິຊາທີ່ພວກເຂົາເຮັດກົງກັບ ID ວິຊາຕົວເລກ.
OPTIONS
- ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງສະບັບຂອງໂຄງການແລະຂໍ້ມູນໃບອະນຸຍາດແລະອອກ
-h, - ຊ່ວຍ, --help-np
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ. --help-np ບັງຄັບປິດການນຳໃຊ້ pager
ສໍາລັບການສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອ.
--ເສັ້ນທາງ PATH
ເສັ້ນທາງໄປຫາໄດເລກະທໍລີຮາກຂອງຊຸດຂໍ້ມູນ OpenFMRI
-t ບັດປະ ຈຳ ຕົວ, -- ວຽກງານ ID
ID ຂອງໜ້າວຽກທີ່ມີຂໍ້ມູນ BOLD fMRI ສຳລັບແຜນ QC. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
--estimate-fname NAME
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ທີ່ມີການຄາດຄະເນການເຄື່ອນໄຫວໃນແຕ່ລະໂຟເດີແລ່ນວຽກ BOLD. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ:
bold_moest.txt
--ພີ່ນ້ອງ REF REF
recode ການຄາດຄະເນທັງຫມົດເປັນຄວາມແຕກຕ່າງຂອງການຄາດຄະເນສໍາລັບປະລິມານ X ໃນການດໍາເນີນງານ Y
(--ພີ່ນ້ອງ YX). ດັດຊະນີທີ່ອີງໃສ່ສູນ!
--exclude-subjs ຂ້ອຍເຮັດ ...]
ບັນຊີລາຍຊື່ຂອງ ID ວິຊາທີ່ແຍກອອກຈາກພື້ນທີ່ເພື່ອຍົກເວັ້ນຈາກການວິເຄາະ QC
--estimate-order LABEL
ລຳດັບຖັນຂອງການຄາດຄະເນໃນໄຟລ໌. `transrot` ຊີ້ໃຫ້ເຫັນການແປພາສາທໍາອິດ,
ປະຕິບັດຕາມດ້ວຍການຫມຸນ. `rottrans` ຫມາຍເຖິງຄໍາສັ່ງກົງກັນຂ້າມ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 'transrot'
--rad2deg
ຖ້າລະບຸ, ການຄາດຄະເນການຫມຸນແມ່ນສົມມຸດເປັນເຣດຽນ ແລະຈະຖືກແປງ
ເຖິງອົງສາ.
--outlier-minthresh OUTLIER_MINTHRESH
ເກນຂັ້ນຕ່ຳຢ່າງແທ້ຈິງຂອງການກວດຫາທີ່ເກີນກວ່າ. ພຽງແຕ່ມີຄ່າໃຫຍ່ກວ່ານີ້
ເກນຈະເຄີຍຖືກພິຈາລະນາວ່າເປັນຂອບເຂດທີ່ເກີນກວ່າ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ມີ
--outlier-stdthresh OUTLIER_STDTHRESH
ເກນຕໍາ່ສຸດໃນຫົວໜ່ວຍຂອງຄ່າບ່ຽງເບນມາດຕະຖານສຳລັບການກວດພົບທີ່ນອກເໜືອໄປກວ່າ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ:
ບໍ່ມີ
--savefig ບັນທຶກ
ຊື່ໄຟລ໌ເພື່ອເກັບຮັກສາຕົວເລກ QC ພາຍໃຕ້. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ມີ
ໃຊ້ pymvpa2-ofmotionqc ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net