ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ xplor2gmx ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
xplor2gmx - ປ່ຽນການຢັບຢັ້ງໄລຍະຫ່າງ XPLOR ເປັນຮູບແບບ Gromacs
ສະຫຼຸບສັງລວມ
xplor2gmx (ສານຕົກຄ້າງ ຊົດເຊີຍ) input.pdb
ລາຍລະອຽດ
xplor2gmx ອ່ານໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ XPLOR ທີ່ມີຂໍ້ມູນການຍັບຍັ້ງໄລຍະຫ່າງຕາມທີ່ພົບໃນບາງຄັ້ງ
ຖານຂໍ້ມູນ pdb (http://www.pdb.org). ຈາກໄຟລ໌ input ນີ້ restricts dihedral ຄວນຈະເປັນ
ໂຍກຍ້າຍອອກ, ມີພຽງແຕ່ການຈໍາກັດໄລຍະຫ່າງເທົ່ານັ້ນ. script ສາມາດຈັດການກັບຄວາມບໍ່ຊັດເຈນ
ຂໍ້ຈຳກັດ. ມັນປ່ຽນການຢັບຢັ້ງໄລຍະຫ່າງເປັນຮູບແບບ GROMACS.
ໄຟລ໌ການຍັບຍັ້ງ (.dat) ຄວນມີຢູ່ໃນ STDIN, ແລະໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ເຫມາະສົມ (.itp) ແມ່ນ
ສົ່ງໄປ STDOUT.
ຕົວຢ່າງ
xplor2gmx.pl 33 conf.pdb < restraints.dat > disre.itp
OPTIONS
xplor2gmx ຕ້ອງການສອງທາງເລືອກແຖວຄໍາສັ່ງ: ທໍາອິດ, residue offset (ຈໍານວນເຕັມ); ທີສອງ,
ຊື່ໄຟລ໌ .pdb. ໄຟລ໌ pdb ຕ້ອງມີຕົວເລກອະຕອມທີ່ຖືກຕ້ອງ.
ໃຊ້ xplor2gmx ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net