ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ Gen3D ເພື່ອໃຊ້ໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ gen3d.cpp. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ Gen3D ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ພາບຫນ້າຈໍ:
Gen3D ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌
DESCRIPTION:
Gen3D ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ອອກແບບມາເພື່ອກໍານົດຕົວແບບສາມມິຕິລະດັບ genome ແລະ chromosome. ມັນໃຊ້ຂໍ້ມູນການຕິດຕໍ່ຂອງໂຄໂມໂຊມເພື່ອສ້າງຄວາມສອດຄ່ອງສາມມິຕິ. ວິທີການນີ້ສາມາດສ້າງແບບຈໍາລອງໂຄໂມໂຊມສາມມິຕິທີ່ພໍໃຈກັບສ່ວນໃຫຍ່ຂອງການຕິດຕໍ່ chromosomal.ຊອບແວໄດ້ຖືກພັດທະນາຢູ່ໃນຫ້ອງທົດລອງຊີວະວິທະຍາ, ການຂຸດຄົ້ນຂໍ້ມູນ ແລະການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກຂອງສາດສະດາຈານ Jianlin Cheng ໃນພາກວິຊາວິທະຍາສາດຄອມພິວເຕີ ທີ່ມະຫາວິທະຍາໄລ Missouri - Columbia, ສະຫະລັດອາເມລິກາ. ໂຄງການດັ່ງກ່າວແມ່ນໄດ້ຮັບການສະຫນັບສະຫນູນໂດຍມູນນິທິວິທະຍາສາດແຫ່ງຊາດ (ໃບອະນຸຍາດໃຫ້ DBI1149224).
ຖ້າທ່ານໃຊ້ Gen3D ໃນການຄົ້ນຄວ້າຂອງທ່ານ, ກະລຸນາອ້າງອີງ:
Nowotny, Jackson, Sharif Ahmed, Lingfei Xu, Oluwatosin Oluwadare, Hannah Chen, Noelan Hensley, Tuan Trieu, Renzhi Cao, ແລະ Jianlin Cheng. "ການສ້າງແບບຊໍ້າຄືນຂອງແບບສາມມິຕິຂອງໂຄໂມໂຊມຂອງມະນຸດຈາກຂໍ້ມູນການຕິດຕໍ່ຂອງໂຄໂມໂຊມ." BMC bioinformatics 16, ສະບັບເລກທີ. 1 (2015): 338.
ຄຸນລັກສະນະ
- ໃຊ້ຂໍ້ມູນການຕິດຕໍ່ຂອງໂຄໂມໂຊມທີ່ໄດ້ມາໂດຍໃຊ້ເຕັກນິກ Hi-C
- ກໍ່ສ້າງຕົວແບບໂຄງສ້າງ 3D ແລະໂຄໂມໂຊມຈາກຂໍ້ມູນການຕິດຕໍ່ຂອງໂຄໂມໂຊມ
- ເລີ່ມຕົ້ນການປະສານງານໂດຍໃຊ້ວິທີການທີ່ເປັນໄປໄດ້
- ວິທີການ Novel ເພື່ອສະແດງການຕິດຕໍ່ທີ່ພໍໃຈໃນແຜນທີ່ຄວາມຮ້ອນ matrix
- ແຜນການໃຫ້ຄະແນນເພື່ອຄິດອອກໄລຍະຍາວແລະການຕິດຕໍ່ໄລຍະສັ້ນ
- ເມື່ອປຽບທຽບກັບວິທີການທີ່ມີຢູ່ແລ້ວອື່ນໆແລະຍັງ validated ກັບລັກສະນະຂອງ genome
Audience
ວິທະຍາສາດ / ການຄົ້ນຄວ້າ, ວິສະວະກໍາ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
C ++
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/gen3d/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.