ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ PTESFinder ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ ptesfinder_v1.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ PTESFinder ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
PTESFinder
DESCRIPTION:
PTESFinder ເປັນທໍ່ການຄິດໄລ່ສໍາລັບການກໍານົດເຫດການ Exon Shuffling Post-transcriptional ຈາກຂໍ້ມູນ RNAseq ທີ່ມີຄວາມໄວສູງ. PTESFinder ນໍາໃຊ້ພະລັງງານຂອງເຄື່ອງມື RNASeq ທີ່ຖືກສ້າງຕັ້ງຂື້ນແລະຍົກເວັ້ນຊັ້ນຮຽນທັງຫມົດທີ່ຮູ້ຈັກຂອງໂຄງສ້າງທາງບວກທີ່ບໍ່ຖືກຕ້ອງໂດຍການນໍາໃຊ້ຕົວກອງທີ່ເຂັ້ມງວດທີ່ອອກແບບມາໂດຍສະເພາະເປົ້າຫມາຍທາງບວກທີ່ບໍ່ຖືກຕ້ອງເຫຼົ່ານີ້. PTESFinder ປຽບທຽບຄຸນນະພາບການຈັດຮຽງຂອງແຜນທີ່ການອ່ານກັບໂຄງສ້າງ PTES ທີ່ມີຄຸນະພາບຂອງການອ່ານດຽວກັນເມື່ອຖືກສ້າງແຜນທີ່ໃສ່ເຂດ genomic ແລະ transcripts canonically spliced. ວິທີການນີ້ເພີ່ມຄວາມຫມັ້ນໃຈໃນ PTES ສະຫນັບສະຫນູນການອ່ານ. ການອ່ານທີ່ອອກມາຈາກເຫດການສະຫຼັບແມ່ແບບແມ່ນມັກຈະຖືກສະແດງໂດຍ indels ຂະຫນາດໃຫຍ່ເມື່ອສອດຄ່ອງກັບການຖອດຂໍ້ຄວາມ. PTESFinder ໃຊ້ຕົວກອງເພີ່ມເຕີມເພື່ອຍົກເວັ້ນການອ່ານທີ່ມີການຈັດວາງທີ່ບໍ່ຊັດເຈນປະມານ PTES exon-exon junctions, ເພີ່ມຄວາມຫມັ້ນໃຈໃນການອ່ານສະຫນັບສະຫນູນເຫຼົ່ານີ້. PTESFinder ກໍານົດໂຄງສ້າງ PTES ຫຼາຍກ່ວາວິທີການທີ່ເຜີຍແຜ່ອື່ນໆໃນຂະນະທີ່ຮັກສາຄວາມສະເພາະສູງ.
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Unix Shell, Java
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.