ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ RGAAT ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ RGAAT.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ RGAAT ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ພາບຫນ້າຈໍ:
RGAAT
DESCRIPTION:
ໂປຣແກມນີ້ສາມາດປະກອບ ແລະ/ຫຼື ປະກອບຄຳອະທິບາຍປະກອບຂອງ genome ສຳລັບ genome ໃໝ່ ແລະການຍົກລະດັບ genome ທີ່ຮູ້ຈັກໂດຍໃຊ້ໄຟລ໌ການຈັດຮຽງລຳດັບ (SAM ຫຼື BAM format), ໄຟລ໌ຕົວແປຕາມລຳດັບ (ຮູບແບບ VCF ຫຼື ຫ້າຕາຕະລາງ coloum (tab-delimited, ລວມທັງ chromosome, position, id, reference) allele ແລະ allele ທາງເລືອກ)) ຫຼືໄຟລ໌ລໍາດັບ genome ໃຫມ່ (ຮູບແບບ FASTA) ໂດຍອີງໃສ່ໄຟລ໌ລໍາດັບ genome ອ້າງອີງ (ຮູບແບບ FASTA) ແລະໄຟລ໌ຄໍາບັນຍາຍ (TBL, GTF, GFF, GFF3 ຫຼືຮູບແບບ BED).
ຄຸນລັກສະນະ
- ການກໍານົດການປ່ຽນແປງລໍາດັບ
- ການສ້າງລໍາດັບຄວາມເຫັນດີນໍາຂອງ genome
- ການດັດແກ້ genome
- ການປຽບທຽບ genome
- ຄໍາອະທິບາຍກ່ຽວກັບ genome
- ການກໍ່ສ້າງ genome ການປະສານງານການປ່ຽນແປງລະຫວ່າງສະບັບປະກອບ genome ທີ່ແຕກຕ່າງກັນ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Perl
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/rgaat/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.