ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ UniPyRange ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ UniPyRangeSuite.py. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ UniPyRange ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ພາບຫນ້າຈໍ:
UniPyRange ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌
DESCRIPTION:
script python ງ່າຍດາຍຫຼາຍທີ່ຊ່ວຍປະຢັດທ່ານຄວາມເຈັບປວດຂອງການນັບອາຊິດ amino / DNA ຖານໃນໄຟລ໌ fasta ຈາກ Uniprot ແລະ NCBI RefSeq Database (1, 2).ໃຫ້ເວົ້າວ່າທ່ານຕ້ອງການລໍາດັບອາຊິດ amino ຂອງລະດັບ 128-387 ຈາກທາດໂປຼຕີນຈາກອາຊິດ amino 1000 - script ນີ້ຈະຊ່ວຍໃຫ້ທ່ານຫຼີກເວັ້ນການນັບຄວາມຜິດພາດໂດຍພຽງແຕ່ສະແດງໃຫ້ທ່ານເຫັນລໍາດັບທີ່ລະບຸໄວ້ໃນອາຊິດ amino ແລະ coding DNA ຄູ່ພື້ນຖານ (ເຫມາະສໍາລັບການອອກແບບ primer ຂະຫຍາຍໃຫຍ່ຂື້ນ. ) ຂອງ Uniprot ID ທີ່ລະບຸ.
- ຕ້ອງການ BioPython (3) ແລະ Bioservices Package (4)
(1)
ສະມາຄົມ UniProt
UniProt: ສູນຂໍ້ມູນຂ່າວສານໂປຣຕີນ
ອາຊິດນິວຄລີອິກ Res. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: ການປັບປຸງກ່ຽວກັບລໍາດັບການອ້າງອິງ mammalian. ອາຊິດນິວຄລີອິກ Res. 2014 Jan 1;42(1):D756-63.
(3)
Cock PJ et al. ຊີວະວິທະຍາ (2009)
(4)
Cokelaer et al, Bioinformatics (2013)
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.