ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ WellMeth ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນຊື່ wellmeth-1.0.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ WellMeth ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
WellMeth ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌
DESCRIPTION:
WellMeth ເປັນກອບປະສົມປະສານສໍາລັບການວິເຄາະການເປັນຕົວແທນ Bisulfite-Seq ຫຼຸດລົງຄຸນລັກສະນະ
- ຂະຫຍາຍວິທີການ Genotyping ໂດຍ Sequencing (GBS) ໃນການກວດພົບຂອງ cytosine methylated ໃນ DNA ພັນທຸ ກຳ.
- ອີງໃສ່ການມີ genomes ອ້າງອີງທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງແລະສໍາລັບການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດ, ການຍ່ອຍສະຫຼາຍຂໍ້ຈໍາກັດສອງເທົ່າດ້ວຍສອງ enzymes methylation-insensitive ແມ່ນແນະນໍາໃຫ້.
- ສໍາລັບການຈັບຄູ່-end short-read sequencing asymmetric forward- and reverse adapters will be used with 4 to 6 nt long barcodes and a fixed number of random nucleotides (Unique Molecular Identifiers, UMIs) ທີ່ຢູ່ຕິດກັບ barcodes.
- ຂໍ້ມູນ UMI ຈະຖືກນໍາໃຊ້ສໍາລັບການກໍານົດຫຼັງການສອດຄ່ອງກັບ PCR ຊໍ້າກັນ
- ປະກອບດ້ວຍສີ່ໂມດູນຊ້ອນກັນ: ການປະມວນຜົນກ່ອນ, ການສ້າງແຜນທີ່, ການກວດຫາຕົວແປ Methylation ແລະ Differential methylation
- ໂມດູນຖືກເຊື່ອມຕໍ່ກັນໂດຍສະຄິບ wrapper ທີ່ສາມາດປັບແຕ່ງໄດ້ອະນຸຍາດໃຫ້ປະຕິບັດອັດຕະໂນມັດຢ່າງເຕັມສ່ວນ.
- ໄວ, ຖືກຕ້ອງແລະນ້ໍາຫນັກເບົາ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
Console/Terminal
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/wellmeth/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.