ນີ້ແມ່ນແອັບ Windows ທີ່ມີຊື່ວ່າ NGSEP ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ NGSEPwindows_4.1.0.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ NGSEP ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ emulator ອອນ ໄລ ນ ໌ OS OnWorks ຈາກ ເວັບ ໄຊ ທ ໌ ນີ້, ແຕ່ ດີກ ວ່າ Windows ອອນ ໄລ ນ ໌ emulator.
- 5. ຈາກ OnWorks Windows OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກແລະຕິດຕັ້ງມັນ.
- 7. ດາວໂຫລດ Wine ຈາກບ່ອນເກັບມ້ຽນຊອບແວການແຈກຢາຍ Linux ຂອງທ່ານ. ເມື່ອຕິດຕັ້ງແລ້ວ, ທ່ານສາມາດຄລິກສອງຄັ້ງ app ເພື່ອດໍາເນີນການໃຫ້ເຂົາເຈົ້າກັບ Wine. ນອກນັ້ນທ່ານຍັງສາມາດລອງ PlayOnLinux, ການໂຕ້ຕອບທີ່ແປກປະຫຼາດໃນໄລຍະ Wine ທີ່ຈະຊ່ວຍໃຫ້ທ່ານຕິດຕັ້ງໂປລແກລມ Windows ແລະເກມທີ່ນິຍົມ.
ເຫຼົ້າແວງເປັນວິທີການແລ່ນຊອບແວ Windows ໃນ Linux, ແຕ່ບໍ່ມີ Windows ທີ່ຕ້ອງການ. ເຫຼົ້າແວງແມ່ນຊັ້ນຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ຂອງ Windows ແຫຼ່ງເປີດທີ່ສາມາດເອີ້ນໃຊ້ໂຄງການ Windows ໂດຍກົງໃນ desktop Linux ໃດກໍໄດ້. ໂດຍພື້ນຖານແລ້ວ, Wine ກໍາລັງພະຍາຍາມປະຕິບັດໃຫມ່ຢ່າງພຽງພໍຂອງ Windows ຕັ້ງແຕ່ເລີ່ມຕົ້ນເພື່ອໃຫ້ມັນສາມາດດໍາເນີນການຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ Windows ທັງຫມົດໄດ້ໂດຍບໍ່ຕ້ອງໃຊ້ Windows.
ພາບຫນ້າຈໍ:
NGSE
DESCRIPTION:
NGSEP ເປັນກອບປະສົມປະສານສໍາລັບການວິເຄາະຂອງຂໍ້ມູນລໍາດັບ DNA ທີ່ມີຄວາມໄວສູງ. ການນໍາໃຊ້ຕົ້ນຕໍຂອງ NGSEP ແມ່ນການກໍ່ສ້າງແລະການວິເຄາະທາງລຸ່ມຂອງຊຸດຂໍ້ມູນຂະຫນາດໃຫຍ່ຂອງການປ່ຽນແປງທາງພັນທຸກໍາ. NGSEP ປະຕິບັດການກວດຫາທີ່ຖືກຕ້ອງ ແລະການຈັດປະເພດພັນທຸກຳຂອງ Single Nucleotide Variants (SNVs), indels ຂະໜາດນ້ອຍ ແລະໃຫຍ່, short tandem repeats (STRs), inversions, ແລະ Copy Number Variants (CNVs). NGSEP ຍັງໃຫ້ໂມດູນສໍາລັບຄໍາບັນຍາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດ, ການກັ່ນຕອງ, ການແປງຮູບແບບ, ການປຽບທຽບ, ການລວບລວມ, ການອ້າງອິງ, ການວິເຄາະ introgression ແລະປະເພດທີ່ແຕກຕ່າງກັນຂອງສະຖິຕິ. ບັນຊີລາຍຊື່ເຕັມຂອງຫນ້າທີ່ສາມາດໃຊ້ໄດ້ໃນ wiki ຂອງພວກເຮົາ (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
ຂ່າວ: ພວກເຮົາຫາກໍ່ມີລຸ້ນທຳອິດຂອງ de-novo genomes assembler ຂອງພວກເຮົາ. ລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມມີຢູ່ໃນ wiki.
ຄຸນລັກສະນະ
- De-novo genomes ປະກອບ
- ການຈັດຮຽງການອ່ານດິບໄປຫາ genome ອ້າງອີງ
- SNPs, CNVs ແລະການກວດຫາຕົວແປໂຄງສ້າງ
- ການຫມູນໃຊ້ VCF: ຄໍາອະທິບາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດ, ລວມ, ການກັ່ນຕອງ, ປຽບທຽບ, ການແປງຮູບແບບ, imputation
- ອ່ານ Demultiplexing
- ການຈັດລຽງຂອງອົງປະກອບພັນທຸກໍາທີ່ລະບຸໄວ້
- ສະຖິຕິແລະການກັ່ນຕອງກ່ຽວກັບການອະທິບາຍບົດຂຽນໃນຮູບແບບ GFF3
Audience
ອຸດສາຫະກໍາການດູແລສຸຂະພາບ, ວິທະຍາສາດ / ການຄົ້ນຄວ້າ, ຜູ້ຊົມອື່ນໆ, ກະສິກໍາ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
Java SWT, Console/Terminal, Eclipse
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Java
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/ngsep/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.