diffseqe - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് പ്രൊവൈഡറിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന ഡിഫ്സെക് കമാൻഡ് ആണിത്.

പട്ടിക:

NAME


diffseq - സമാനമായ രണ്ട് സീക്വൻസുകളുടെ സവിശേഷതകൾ താരതമ്യം ചെയ്ത് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുക

സിനോപ്സിസ്


diffseq - ക്രമം ക്രമം - അനുക്രമം ക്രമം - വാക്കുകളുടെ വലിപ്പം പൂർണ്ണസംഖ്യ
[- ആഗോള വ്യത്യാസങ്ങൾ ബൂളിയൻ] - outfile റിപ്പോർട്ട് -ഔട്ട്ഫീറ്റ് ഫീറ്റ്ഔട്ട് -ബൗട്ട്ഫീറ്റ് ഫീറ്റ്ഔട്ട്

diffseq -ഹെൽപ്പ്

വിവരണം


diffseq EMBOSS-ൽ നിന്നുള്ള ഒരു കമാൻഡ് ലൈൻ പ്രോഗ്രാമാണ് ("യൂറോപ്യൻ മോളിക്യുലാർ ബയോളജി ഓപ്പൺ
സോഫ്റ്റ്‌വെയർ സ്യൂട്ട്"). ഇത് "വിന്യാസം:വ്യത്യാസങ്ങൾ" കമാൻഡ് ഗ്രൂപ്പിന്റെ (ങ്ങളുടെ) ഭാഗമാണ്.

ഓപ്ഷനുകൾ


ഇൻപുട്ട് വിഭാഗം
- ക്രമം ക്രമം

- അനുക്രമം ക്രമം

ആവശ്യമായ വിഭാഗം
- വാക്കുകളുടെ വലിപ്പം പൂർണ്ണസംഖ്യ
രണ്ട് സീക്വൻസുകൾക്കിടയിലുള്ള സമാന പ്രദേശങ്ങൾ ഒരു ഹാഷ് ടേബിൾ സൃഷ്ടിച്ച് കണ്ടെത്തുന്നു
വാക്കുകളുടെ വലിപ്പത്തിലുള്ള തുടർച്ചകൾ. 10 ന്യായമായ സ്ഥിരസ്ഥിതിയാണ്. ഈ മൂല്യം വലുതാക്കുന്നു (20?)
പ്രോഗ്രാം അൽപ്പം വേഗത്തിലാക്കാം, എന്നാൽ അതിനുള്ളിൽ ഏതെങ്കിലും രണ്ട് വ്യത്യാസങ്ങൾ ഉണ്ടെന്ന് അർത്ഥമാക്കുന്നു
പരസ്പരം 'പദ വലുപ്പം' വ്യത്യാസത്തിന്റെ ഒരു മേഖലയായി തരംതിരിക്കും. ഈ മൂല്യം
സമീപത്തുള്ള വ്യത്യാസങ്ങളുടെ പരിഹാരം മെച്ചപ്പെടുത്തുന്നതിന് (4?) ചെറുതാക്കിയേക്കാം, എന്നാൽ
പ്രോഗ്രാം വളരെ പതുക്കെ പോകും. സ്ഥിര മൂല്യം: 10

അധികമായ വിഭാഗം
- ആഗോള വ്യത്യാസങ്ങൾ ബൂളിയൻ
സാധാരണയായി ഈ പ്രോഗ്രാം ഐഡന്റിറ്റിയുടെ ദൈർഘ്യമുള്ള പ്രദേശങ്ങൾ കണ്ടെത്തും
വാക്കിന്റെ വലുപ്പമോ അതിൽ കൂടുതലോ വ്യക്തമാക്കിയിട്ടുണ്ട്, തുടർന്ന് അവ തമ്മിലുള്ള വ്യത്യാസമുള്ള പ്രദേശങ്ങൾ റിപ്പോർട്ടുചെയ്യും
ഈ പൊരുത്തപ്പെടുന്ന പ്രദേശങ്ങൾ. ഇത് നന്നായി പ്രവർത്തിക്കുന്നു, അങ്ങനെയാണെങ്കിൽ മിക്ക ആളുകളും ആഗ്രഹിക്കുന്നത് ഇതാണ്
നീണ്ട ഓവർലാപ്പിംഗ് ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ് സീക്വൻസുകളിൽ പ്രവർത്തിക്കുന്നു. നിങ്ങൾക്ക് സാധാരണയായി താൽപ്പര്യമില്ല
ഈ സീക്വൻസുകളുടെ ഓവർലാപ്പുചെയ്യാത്ത അറ്റങ്ങളിൽ. നിങ്ങൾക്ക് പ്രോട്ടീൻ സീക്വൻസുകളോ ചെറുതോ ആണെങ്കിൽ
എന്നിരുന്നാലും, ആർഎൻഎ സീക്വൻസുകൾ, നിങ്ങൾക്ക് അവസാനത്തിൽ തന്നെ വ്യത്യാസങ്ങളിൽ താൽപ്പര്യമുണ്ടാകും. അത്
ഈ ഓപ്‌ഷൻ ശരിയാണെന്ന് സജ്ജീകരിച്ചാൽ അറ്റത്തുള്ള വ്യത്യാസങ്ങളും റിപ്പോർട്ടുചെയ്യപ്പെടും.
സ്ഥിര മൂല്യം: എൻ

ഔട്ട്പുട്ട് വിഭാഗം
- outfile റിപ്പോർട്ട്

-ഔട്ട്ഫീറ്റ് ഫീറ്റ്ഔട്ട്
ആദ്യ ശ്രേണിയുടെ സവിശേഷതകളുടെ ഔട്ട്പുട്ടിനുള്ള ഫയൽ ഡിഫോൾട്ട് മൂല്യം: $(asequence.name).diffgff

-ബൗട്ട്ഫീറ്റ് ഫീറ്റ്ഔട്ട്
രണ്ടാം ശ്രേണിയുടെ സവിശേഷതകളുടെ ഔട്ട്‌പുട്ടിനുള്ള ഫയൽ ഡിഫോൾട്ട് മൂല്യം: $(bsequence.name).diffgff

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് diffseqe ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക



ഏറ്റവും പുതിയ ലിനക്സ്, വിൻഡോസ് ഓൺലൈൻ പ്രോഗ്രാമുകൾ