GMATAv2.2.jar എന്ന പേരിൽ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാവുന്ന ജീനോമിക് എസ്എസ്ആർ മാർക്കറിനായുള്ള GMATA സോഫ്റ്റ്വെയർ എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ലിനക്സ് ആപ്പാണിത്. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
ജീനോമിക് എസ്എസ്ആർ മാർക്കറിനായുള്ള GMATA സോഫ്റ്റ്വെയർ എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-നൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ:
ജീനോമിക് എസ്എസ്ആർ മാർക്കറിനായുള്ള GMATA സോഫ്റ്റ്വെയർ
വിവരണം:
എന്താണ് സോഫ്റ്റ്വെയർ GMATA v21
ജീനോം-വൈഡ് മൈക്രോസാറ്റലൈറ്റ് അനലൈസിംഗ് ടുവേർഡ് ആപ്ലിക്കേഷൻ (ജിഎംഎടിഎ) എന്നത് സിമ്പിൾ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റ്സ് (എസ്എസ്ആർ) വിശകലനത്തിനും എസ്എസ്ആർ മാർക്കർ ഡിസൈനിംഗിനും മാപ്പിംഗിനും വേണ്ടിയുള്ള ഒരു സോഫ്റ്റ്വെയറാണ്. ഇതിന് ഇനിപ്പറയുന്ന പ്രവർത്തനങ്ങൾ ഉണ്ട്:
1. എസ്എസ്ആർ ഖനനം;
2. സ്റ്റാറ്റിസ്റ്റിക്കൽ വിശകലനവും പ്ലോട്ടിംഗും;
3. എസ്എസ്ആർ ലോക്കി ഗ്രാഫിക് വ്യൂവിംഗ്;
4. മാർക്കർ ഡിസൈനിംഗ്;
5. ഇലക്ട്രോണിക് മാപ്പിംഗും മാർക്കർ ട്രാൻസ്ഫറബിലിറ്റി അന്വേഷണവും.
GMATA കൃത്യവും സെൻസിറ്റീവും വേഗതയേറിയതുമാണ്. വലിയ ജീനോമിക് സീക്വൻസ് ഡാറ്റ സെറ്റുകൾ, പ്രത്യേകിച്ച് വലിയ മുഴുവൻ ജീനോം സീക്വൻസുകൾ പ്രോസസ്സ് ചെയ്യുന്നതിനാണ് ഇത് രൂപകൽപ്പന ചെയ്തിരിക്കുന്നത്. സിദ്ധാന്തത്തിൽ, ഏത് വലിപ്പത്തിലുമുള്ള ജീനോമുകൾ GMATA-യ്ക്ക് എളുപ്പത്തിൽ വിശകലനം ചെയ്യാൻ കഴിയും. സോഫ്റ്റ്വെയർ GMATA സെവർ, ഡെസ്‌ക്‌ടോപ്പ് അല്ലെങ്കിൽ ലാപ്‌ടോപ്പ് എന്നിവയിൽ പ്രവർത്തിക്കുന്നു, മാത്രമല്ല ഇതിന് ഗ്രാഫിക് ഇന്റർഫേസിൽ ക്ലിക്കുകളിലൂടെ പ്രവർത്തിക്കാനോ കമാൻഡ് ലൈനിലോ ഓട്ടോമേറ്റഡ് പൈപ്പ്‌ലൈനിലോ പ്രവർത്തിക്കാനോ കഴിയും. ഇത് ക്രോസ്-പ്ലാറ്റ്ഫോം കൂടിയാണ് കൂടാതെ Unix/Linux, Win, Mac എന്നിവയെ പിന്തുണയ്ക്കുന്നു. GMATA എന്ന സോഫ്റ്റ്‌വെയറിൽ നിന്നുള്ള ഫലങ്ങൾ Gbrowser-ൽ ജീനോം അല്ലെങ്കിൽ ജീൻ ഫീച്ചറുകൾ ഉപയോഗിച്ച് നേരിട്ട് ഗ്രാഫിക്കായി പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും ഏതെങ്കിലും ജീനോമിക് ഡാറ്റാബേസുമായി എളുപ്പത്തിൽ സംയോജിപ്പിക്കുകയും ചെയ്യാം.
സവിശേഷതകൾ
- ഏത് വലിയ ശ്രേണിയിലും കൃത്യവും വേഗതയേറിയതുമായ SSR ഖനനം
- സമ്പൂർണ്ണ സ്റ്റാറ്റിസ്റ്റിക്കൽ വിശകലനവും പ്ലോട്ടിംഗും
- ജീനോം സവിശേഷതകളുള്ള Gbrowser-ൽ SSR ലോക്കിയും മാർക്കർ ഗ്രാഫിക് പ്രദർശനവും
- നിർദ്ദിഷ്ട എസ്എസ്ആർ മാർക്കർ ഡിസൈനിംഗും സിമുലേറ്റഡ് പിസിആർ
- ഇലക്ട്രോണിക് മാപ്പിംഗ്, മാർക്കർ ട്രാൻസ്ഫറബിലിറ്റി അന്വേഷണം
- എന്നതിലും ലഭ്യമാണ് https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
ഇത് https://sourceforge.net/projects/gmata/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.