PTESFinder എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് ptesfinder_v1.tar.gz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
PTESFinder എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-നൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
PTESFinder
വിവരണം:
ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് RNAseq ഡാറ്റയിൽ നിന്ന് പോസ്റ്റ്-ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്‌ഷണൽ എക്‌സൺ ഷഫ്ലിംഗ് ഇവന്റുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നതിനുള്ള ഒരു കമ്പ്യൂട്ടേഷണൽ പൈപ്പ്‌ലൈനാണ് PTESFinder. PTESFinder സ്ഥാപിതമായ RNASeq ടൂളുകളുടെ ശക്തി പ്രയോജനപ്പെടുത്തുകയും ഈ തെറ്റായ പോസിറ്റീവുകളെ പ്രത്യേകമായി ടാർഗെറ്റുചെയ്യാൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്‌തിരിക്കുന്ന കർശനമായ ഫിൽട്ടറുകൾ പ്രയോഗിച്ച് തെറ്റായ പോസിറ്റീവ് ഘടനകളുടെ അറിയപ്പെടുന്ന എല്ലാ ക്ലാസുകളെയും വ്യവസ്ഥാപിതമായി ഒഴിവാക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. ജീനോമിക് മേഖലകളിലേക്കും കാനോനികമായി സ്‌പ്ലൈസ് ചെയ്‌ത ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റുകളിലേക്കും മാപ്പ് ചെയ്യുമ്പോൾ അതേ റീഡുകളുടെ ഗുണങ്ങളുള്ള റീഡ്‌സ് മാപ്പിംഗിന്റെ വിന്യാസ ഗുണങ്ങളെ പുട്ടേറ്റീവ് PTES ഘടനകളുമായി PTESFinder താരതമ്യം ചെയ്യുന്നു. ഈ സമീപനം PTES പിന്തുണയ്ക്കുന്ന വായനകളിൽ ആത്മവിശ്വാസം വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു. ടെംപ്ലേറ്റ്-സ്വിച്ചിംഗ് ഇവന്റുകളിൽ നിന്ന് പുറപ്പെടുന്ന വായനകൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റിലേക്ക് വിന്യസിക്കുമ്പോൾ പലപ്പോഴും വലിയ ഇൻഡലുകളുടെ സവിശേഷതയാണ്. PTES എക്‌സോൺ-എക്‌സോൺ ജംഗ്‌ഷനുകൾക്ക് ചുറ്റുമുള്ള അവ്യക്തമായ വിന്യാസങ്ങളുള്ള വായനകൾ ഒഴിവാക്കുന്നതിന് PTESFinder അധിക ഫിൽട്ടറുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു, ഇത് പിന്തുണയ്ക്കുന്ന ഈ വായനകളിൽ കൂടുതൽ ആത്മവിശ്വാസം വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു. PTESFinder മറ്റ് പ്രസിദ്ധീകരിച്ച രീതികളേക്കാൾ കൂടുതൽ PTES ഘടനകളെ തിരിച്ചറിയുന്നു, അതേസമയം ഉയർന്ന പ്രത്യേകത നിലനിർത്തുന്നു.
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
യുണിക്സ് ഷെൽ, ജാവ
Categories
https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണിത്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.