Ini ialah arahan altree-convertp yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
altree-convert - Tajuk...
SINOPSIS
altree-convert [pilihan]
Pilihan:
--versi versi program
--short-help|h mesej bantuan ringkas
--mesej bantuan bantuan dengan penerangan pilihan
--manusia dokumentasi penuh
--first-input-file|i fail input 1
--second-input-file|j input fail 2 (tidak wajib)
--output-file|o fail output
--case-control-output|c output yang mengandungi kes/kawalan nb
--data-type|t DNA|NUM
--phylo-prog|p PAUP|PHYLIP
--reconstruct-prog|r FASA|FAMHAP
--data-quali|q Jenis data: kualitatif atau kuantitatif
--nbind-threshold|s Bilangan minimum individu yang diperoleh untuk menyimpan haplotaip
PILIHAN
--versi
Cetak versi program dan keluar.
--bantuan pendek
Cetak mesej bantuan ringkas dan keluar.
- membantu Cetak mesej bantuan dengan penerangan pilihan dan keluar.
--lelaki Mencetak halaman manual dan keluar.
--fail-masukan-pertama|i
Input fail 1 (output program pembinaan semula haplotype)
--second-input-file|j
Fail input 2 (output kedua famhap atau fail yang mengandungi status penyakit)
--output-file|o
Fail keluaran
--case-control-output|c
Fail output yang mengandungi bilangan kes dan kawalan yang membawa setiap haplotaip
--jenis data|t "DNA"|"SNP"
Jenis data: DNA (ATGCU) atau SNP (0-1)
--phylo-prog|p "phylip"|"paup"
Program pembinaan semula filogeni
bina semula-prog|r "famhap|fasa"
Program pembinaan semula Haplotype
data-kualiti|q "kualitatif|kuantitatif"
Jenis data yang dianalisis
nbind-threshold|s
Bilangan minimum individu yang membawa haplotaip diperlukan untuk menyimpannya
analisis lanjut. Jika anda ingin menyimpan semua haplotip, anda mesti menjejaskan 0 kepada ini
berubah-ubah
DESCRIPTION
ini program akan membaca fail input yang diberikan dan menjana fail input untuk
perisian pembinaan semula filogenetik paup atau phylip/paml
Gunakan altree-convertp dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net