Ini ialah arahan bp_run_protdist.plp yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS
JADUAL:
NAMA
run_neighbor - jalankan program 'protdist' Phylip melalui Bioperl
SINOPSIS
run_protdist [-i inputfile] [-o outfilename]
DESCRIPTION
Sediakan fail penjajaran untuk menjalankan protdist. Fail hendaklah dinamakan sama ada .aln atau .phy.
Ini diperlukan supaya kita boleh menentukan sama ada kita perlu menukar penjajaran klustal ke
philip. Anda dialu-alukan untuk melanjutkan skrip untuk bekerja pada format MSA lain yang bioperl
menyokong. Ini bertujuan untuk digunakan dalam saluran paip manual yang sangat mudah.
Fail input hendaklah dinamakan dalam bentuk file.phy atau file.aln program mengharapkan a
fail dalam bentuk (\S+)\.(\S+).
Ini akan menjalankan aplikasi 'protdist' menggunakan formula 'KIMURA' untuk membina protein aa
matriks jarak. Mereka yang mempunyai phylip3.6 akan mahu membuat beberapa perubahan jika mereka mahu menggunakan
JTT. Saya berbesar hati untuk membantu menambahkan ini sebagai hujah baris cmd jika ia diminta.
Gunakan bp_run_protdist.plp dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net