cmtk-reformatx - Dalam Talian di Awan

JADUAL:

NAMA

reformatx - Pemformat semula volum

SINOPSIS

reformatx [pilihan] --floating floatingImg sasaran x0 [x1 ...]
ATAU reformatx [pilihan] sasaran [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
ATAU DI MANA x0 ... xN dan xx0 ... xxN ialah penjelmaan [{-i,--songsang}]##. (Jika yang pertama
penjelmaan dalam jujukan adalah songsang, maka '--inverse' mesti didahului dengan '--',
iaitu, gunakan '-- --inverse xform.path').

DESCRIPTION

Alat pemformat semula volum lanjutan untuk mengira imej yang diformat semula dan peta Jacobian
jujukan sewenang-wenang transformasi bercantum

PILIHAN

Global Toolkit Pilihan (ini adalah dikongsi by semua CMTK alatan)
- membantu
Tulis senarai pilihan baris arahan asas kepada output standard.

--bantu-semua
Tulis senarai lengkap pilihan baris perintah asas dan lanjutan kepada output standard.

--wiki
Tulis senarai pilihan baris arahan kepada output standard dalam penanda MediaWiki.

--lelaki
Tulis sumber halaman manual dalam penanda 'nroff' kepada output standard.

--versi
Tulis versi kit alat kepada output standard.

--gema
Tulis baris arahan semasa kepada output standard.

--peringkat-verbose
Tetapkan tahap verbositi.

--verbose, -v
Naikkan tahap verbositi sebanyak 1 (ditamatkan; disokong untuk keserasian ke belakang).

--benang
Tetapkan bilangan maksimum utas selari (untuk utas POSIX dan OpenMP).

--jenis output
Jenis data skalar untuk imej output. Nilai yang disokong: "char", "bait", "short",
"ushort", "int", "uint", "float", "double", atau gunakan salah satu daripada yang berikut:

--char
8 bit, ditandatangani

--bait
8 bit, tidak ditandatangani

--pendek
16 bit, ditandatangani

--ushort
16 bit, tidak ditandatangani

--int
32 bit ditandatangani

--uint
32 bit tidak ditandatangani

--terapung
32 bit titik terapung

--berganda
64 bit titik terapung

--pad-out , -P
Nilai padding untuk imej output [Lalai: 0]

Pilihan Untuk Kosong Memformat semula
--interpolasi
Kaedah interpolasi imej. Nilai yang disokong: "linear", "nn", "kubik", "pv", "sinc-
kosinus", "sinc-hamming", dengan lalainya ialah "linear", atau gunakan salah satu daripada yang berikut:

--linear
Interpolasi trilinear [Ini is yang lalai]

--nn Interpolasi jiran terdekat

--kubik
Interpolasi trikubik

--pv Interpolasi isipadu separa

--sinc-kosinus
Interpolasi sin dengan tetingkap kosinus

--sinc-hamming
Interpolasi Sin dengan tetingkap Hamming

--sinc-window-radius
Jejari tetingkap untuk interpolasi Sinc [Lalai: 3]

--memelihara-jisim
Pemformatan semula pemeliharaan besar-besaran: darabkan setiap nilai yang diformat semula dengan Jacobian
penentu transformasi yang digunakan.

Pilihan Untuk Jacobian Peta Memformat semula
--jacobian-correct-global
Peta Jacobian yang betul untuk skala global.

--no-jacobian-correct-global
Jangan betulkan peta Jacobian untuk skala global. [Ini is yang lalai]

Input Pilihan
--grid-target
Tentukan grid sasaran untuk pemformatan semula sebagai Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(malap:piksel:mengimbangi)

--topeng, -m
Gunakan data piksel sasaran sebagai topeng binari.

--potong
Pangkas imej sasaran: x0,y0,z0,x1,y1,z2

--target-offset , -O
Gantikan imej sasaran mengimbangi dan ditetapkan kepada x,y,z mm

--sasaran-offset-piksel
Gantikan mengimbangi imej sasaran dan tetapkan kepada piksel dx,dy,dz

--terapung , -F
Format dan laluan imej terapung. [Lalai: TIADA]

--pad-terapung
Nilai padding untuk imej terapung [Lalai: kurang upaya]

Output Pilihan
--fail luar , -o
Format dan laluan imej output. [Lalai: format semula.nii ]

Imej/Transformasi Pangkalan Data
--db
Laluan ke pangkalan data imej/transformasi yang harus dikemas kini dengan yang baru dibuat
gambar. [Lalai: TIADA]

PENGARANG

Torsten Rohlfing, dengan sumbangan daripada Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, dan Yaroslav Halchenko

Gunakan cmtk-reformatx dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net