Ini ialah arahan HPCmapper yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
HPCmapper - menjana skrip untuk memetakan bacaan
SINOPSIS
HPCmapper [-vb] [-kint(20)] [-wint(6)] [-hint(50)] [-tint] [-Mint]
[-edua kali ganda(.85)][-lint(1000)] [-sint(100)] [-Hint] [-mmenjejaki]+ [-dalint(4)] [-degint(25)]
ruj:db|empangan berbunyi:db|dam [pertama:int[-terakhir:int]]
DESCRIPTION
HPCmapper menulis skrip shell UNIX kepada output standard yang terdiri daripada urutan
arahan yang berkesan "memetakan" setiap bacaan dalam DB dibaca terhadap set rujukan daripada
urutan dalam DB ref, merekodkan semua penjajaran setempat yang ditemui dalam jujukan fail
ref.reads.1.las, ref.reads.2.las, dan seterusnya, di mana ref.reads.k.las mengandungi penjajaran
antara semua ref dan blok k'th dibaca. Parameternya betul-betul sama seperti
Untuk HPCdaligner(1) menyimpan bahawa -k, -h, dan -e lalai ditetapkan dengan sewajarnya untuk
pemetaan, dan -A and -I pilihan tidak masuk akal kerana ref and dibaca dijangka menjadi
set data yang berbeza.
Jika integer pertama and lepas tiada, maka skrip yang dihasilkan adalah untuk setiap blok masuk
pangkalan data dibaca. Jika pertama hadir kemudian HPCmapper menghasilkan skrip yang membandingkan
blok pertama melalui lepas (lepas = pertama jika tidak hadir) terhadap DAM ref.
Gunakan HPCmapper dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net