Ini ialah apl Linux bernama PTESFinder yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai ptesfinder_v1.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama PTESFinder ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
PTESFinder
HURAIAN:
PTESFinder ialah saluran pengiraan untuk mengenal pasti peristiwa Pemocokan Exon Pasca transkrip daripada data RNAseq pemprosesan tinggi. PTESFinder memanfaatkan kuasa alatan RNASeq yang telah ditetapkan dan secara sistematik mengecualikan semua kelas struktur positif palsu yang diketahui dengan menggunakan penapis ketat yang direka untuk menyasarkan positif palsu ini secara khusus. PTESFinder membandingkan kualiti penjajaran pemetaan bacaan kepada struktur PTES yang diduga dengan kualiti bacaan yang sama apabila dipetakan ke kawasan genomik dan transkrip yang disambung secara kanonik. Pendekatan ini meningkatkan keyakinan terhadap bacaan sokongan PTES. Bacaan yang berpunca daripada peristiwa penukaran templat sering dicirikan oleh indel besar apabila diselaraskan dengan transkrip. PTESFinder menggunakan penapis tambahan untuk mengecualikan bacaan dengan penjajaran samar-samar di sekitar persimpangan exon-exon PTES, seterusnya meningkatkan keyakinan dalam bacaan sokongan ini. PTESFinder mengenal pasti lebih banyak struktur PTES daripada kaedah lain yang diterbitkan sambil mengekalkan kekhususan yang tinggi.
Penonton
Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Barisan arahan
Bahasa Pengaturcaraan
Unix Shell, Java
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.