Dit is de opdracht cmtk-dcm2image die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
dcm2image - DICOM naar afbeelding
KORTE INHOUD
dcm2afbeelding ZoekenDirList
PRODUCTBESCHRIJVING
Combineer sets DICOM-plakken tot 3D-beeldstapels
OPTIES
Globaal Toolkit Opties (deze zijn gedeeld by allen CMTK hulpmiddelen)
--help
Schrijf een lijst met basisopdrachtregelopties naar standaarduitvoer.
--Help iedereen
Schrijf een volledige lijst met basis- en geavanceerde opdrachtregelopties naar standaarduitvoer.
--wiki
Schrijf een lijst met opdrachtregelopties naar standaarduitvoer in MediaWiki-opmaak.
--Mens
Schrijf de man-paginabron in 'nroff'-opmaak naar standaarduitvoer.
--versie
Schrijf toolkitversie naar standaarduitvoer.
--echo
Schrijf de huidige opdrachtregel naar de standaarduitvoer.
--uitgebreid-niveau
Stel breedsprakigheidsniveau in.
--uitgebreid, -v
Verhoog het breedsprakigheidsniveau met 1 (verouderd; ondersteund voor achterwaartse compatibiliteit).
--draden
Stel het maximum aantal parallelle threads in (voor POSIX-threads en OpenMP).
Hoofd Opties
--geen vooruitgang
Voortgangsrapportage uitschakelen.
Invoer Opties
--recursie, -r
Recursie in mappen
uitgang Opties
--out-patroon , -O
Uitvoer afbeeldingspadpatroon. Gebruik de volgende vervangingen: printf-stijl %d variante
(afbeeldingsnummer); %n (afbeeldingsnummer met automatisch aantal cijfers); %N (zoals %n, maar
met een koppelteken '-' vóór het nummer als er meer dan één afbeelding is); %D (DICOM
seriebeschrijving); %R (DICOM-herhalingstijd - alleen MRI); %E (DICOM EchoTime - MRI
alleen); %T (RawDataType - leverancierspecifiek, momenteel alleen GE MRI) [Standaard:
afbeelding%n.nii ]
--xml, -x
Schrijf een XML-zijspanbestand voor elke gemaakte afbeelding.
--include-ID's
Voeg mogelijk beschermde identificatiegegevens toe (bijvoorbeeld UID's, serienummer van het apparaat).
getallen, datums) in de gemaakte XML-zijspanbestanden.
--integreren
Sluit DICOM-informatie in uitvoerafbeeldingen in als 'beschrijving' (indien ondersteund door output
bestandsformaat). Ondersteunde waarden: "StudyID_StudyDate", "PatientName",
"SeriesDescription", "None", waarbij de standaardwaarde "None" is, of gebruik een van de
volgende:
--StudieID_StudieDatum
StudyID, tag (0020,0010), vervolgens onderstrepingsteken, gevolgd door StudyDate, tag
(0008,0020). Datum is toegevoegd omdat StudyID slechts uit vier cijfers bestaat en dat ook zal doen
vroeg of laat herhalen.
--Patient naam
Patiëntnaam, tag (0010,0010)
--Seriebeschrijving
Seriebeschrijving, tag (0008,103e)
--Geen
Geen informatie insluiten - laat het veld 'beschrijving' leeg. [Dit is the standaard]
Filtering Opties
--filter
Filter DICOM-bestanden en neem alleen de bestanden op die overeenkomen met het opgegeven patroon van het formulier
'TagName=text', zodat de waarde van de DICOM-tag met de opgegeven naam de
gegeven tekst. Als er meerdere filterpatronen beschikbaar zijn door herhaaldelijk gebruik van deze optie,
alleen bestanden die overeenkomen met ALLE patronen zijn opgenomen.
--uitsluiten
Sluit alle DICOM-bestanden uit die overeenkomen met het gegeven patroon van de vorm 'TagNaam=tekst', zoals
dat de waarde van de DICOM-tag met de opgegeven naam de opgegeven tekst bevat. Als
er zijn meerdere uitsluitingspatronen beschikbaar, alle bestanden die overeenkomen met ELK van de
de patronen.
Sorteren Opties
--geen sortering
Sorteer bestanden NIET op bestandsnaam (sorteren bepaalt de stapelvolgorde van afbeeldingen bij het oplossen
ruimtelijke botsingen)
--Sorteren op naam
Sorteer bestanden lexicografisch op bestandsnaam. Gebruik dit wanneer instantienummers niet-
uniek.
--sorteer op exemplaar
Sorteer bestanden op afbeeldingsinstantienummer. Gebruik dit als bestandsnamen verschillende lengtes hebben,
enz. [Dit is the standaard]
Stapelen Opties
--schrijf-enkele-segmenten
Schrijf ook uitvoerafbeeldingen voor single-slice DICOM-bestanden waaraan niet kon worden toegewezen
alle 3D-stapels. Standaard worden deze overgeslagen.
--negeer-acq-nummer
Negeer de tag 'AcquisitionNumber' voor het groeperen van afbeeldingen, dwz niet op basis van stapels scheiden
op dit label.
--geen-oriëntatie-check
Controle van afbeeldingsoriëntaties uitschakelen (om afrondingsproblemen te voorkomen)
--tolerantie
Tolerantie voor vergelijkingen met drijvende komma (moet >= 0 zijn; 0 = alleen exacte overeenkomsten;
standaard: 1e-5). Als een of meer volumes niet kunnen worden gestapeld vanwege een niet-uniforme slice
afstand die deze drempel overschrijdt, retourneert dcm2image een afsluitcode van 3.
[Standaard: 1e-05]
AUTEURS
Torsten Rohlfing, met bijdragen van Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff en Yaroslav Halchenko
Gebruik cmtk-dcm2image online met behulp van onworks.net-services