Dit is de opdracht maskseqe die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
maskseq - Schrijf een reeks met gemaskeerde regio's
KORTE INHOUD
maskerseq -volgorde volgorde -Regio's reeks [-verlagen toggle] -maskerchar snaar
-buitensq vervolg
maskerseq -Help
PRODUCTBESCHRIJVING
maskerseq is een commandoregelprogramma van EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
softwarepakket"). Het maakt deel uit van de opdrachtgroep(en) "Bewerken".
OPTIES
Invoer sectie
-volgorde volgorde
Nodig sectie
-Regio's reeks
Regio's om te maskeren. Een set regio's wordt gespecificeerd door een set paren posities. De
posities zijn gehele getallen. Ze worden gescheiden door elk niet-cijferig, niet-alfa-teken.
Voorbeelden van regiospecificaties zijn: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
Extra sectie
-verlagen toggle
De regio kan worden 'gemaskeerd' door de reekstekens om te zetten in kleine letters, sommige
niet-EMBOSS-programma's zoals fasta kunnen dit interpreteren als een gemaskeerd gebied. De volgorde is
ongewijzigd, afgezien van de wijziging van de zaak. Misschien wilt u ervoor zorgen dat de hele reeks
is in hoofdletters voordat de gespecificeerde regio's worden gemaskeerd naar kleine letters met behulp van de
vlag '-avondmaal'. Standaardwaarde: N
-maskerchar snaar
Karakter dat moet worden gebruikt bij het maskeren. Standaard is 'X' voor eiwitsequenties, 'N' voor nucleïnezuur
sequenties. Als het maskerteken is ingesteld als SPACE-teken of een null-teken,
dan wordt de reeks 'gemaskeerd' door deze te veranderen in kleine letters, net als bij de
vlag '-kleine letters'. Standaardwaarde: @($(acdproteïne)?X:N)
uitgang sectie
-buitensq vervolg
Maskseqe online gebruiken met onworks.net-services