Dit is de Linux-app genaamd CoVEC waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als covec_distribution-v0.4.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd CoVEC gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
CoVEC
BESCHRIJVING:
Het pakket bevat SVM-modellen die kunnen worden gebruikt met SVMlight (http://svmlight.joachims.org/) voor het trekken van een consensus uit individuele voorspellingen van derden over het effect van mutaties. De tools van derden zijn SIFT, Polyphen3, SNPs&GO en Mutation Assessor.
Het pakket biedt ook een reeks Perl-modules en -scripts om te helpen bij het voorbereiden van gegevens. De modules kunnen worden gebruikt om aangepaste tools en pijplijnen te bouwen, terwijl de scripts eenvoudige uitvoerbare implementaties bieden op basis van de modules.
SVMlight, SIFT, Polyphen2, SNPs&GO en Mutation Assessor zijn eigendom van hun respectievelijke auteurs en instellingen en worden niet in dit pakket gedistribueerd.
Toehoorders
Gezondheidszorgindustrie, Wetenschap/Onderzoek, Ontwikkelaars
Gebruikersinterface
Console/Terminal, Opdrachtregel
Programmeertaal
Perl
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/covec/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.