Dit is de Linux-app CTK, waarvan de nieuwste versie kan worden gedownload als Version1.1.5sourcecode.tar.gz. Deze kan online worden uitgevoerd via de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik online gratis deze app met de naam CTK met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCHERMSCHERMEN:
CTK
BESCHRIJVING:
CTK (CLIP Tool Kit) is een computationele biologie-toolkit, geïmplementeerd in Perl, ontworpen voor het analyseren van CLIP-sequencingdata. Het biedt een gestroomlijnde pijplijn van ruwe reads tot piekoproeping en motiefdetectie.
Kenmerken
- Parseert onbewerkte CLIP-seq-lezingen en voert kwaliteitsfiltering uit
- Identificeert cross-linking-geïnduceerde mutatiesites (CIMS)
- Detecteert verrijkte RNA-motiefregio's en pieken
- Geeft gestandaardiseerde BED/narrowPeak-formaten uit
- Uitbreidbaar via Perl-scripts (bijv. tag2cluster, tag2collapse)
- Uitgebreide documentatie en actieve gebruikersondersteuningsgroep
Programmeertaal
Perl
Categorieën
Deze applicatie kan ook worden gedownload van https://sourceforge.net/projects/ctk.mirror/. Deze is gehost in OnWorks, zodat deze eenvoudig online kan worden uitgevoerd via een van onze gratis besturingssystemen.