Dit is de Linux-app genaamd miRge3 waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als unmapped_tmp.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd miRge3 gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
miRge3
BESCHRIJVING:
Een update voor het Python-pakket om uitgebreide analyses uit te voeren van kleine RNA-sequentiegegevens, inclusief miRNA-annotatie, A-naar-I-bewerking, nieuwe miRNA-detectie, isomiR-analyse, visualisatie via IGV, verwerking van Unique Molecular Identifieres (UMI), tRF-detectie en het produceren van interactieve grafische uitvoer.
miRge3.0 is ontwikkeld in Python v3.8 en is een recente update van onze vorige versie miRge2.0. Deze build omvat een opdrachtregelinterface (CLI) en een platformonafhankelijke grafische gebruikersinterface (GUI). Raadpleeg de onderstaande documentatielink voor meer details.
Toehoorders
Non-profitorganisaties, informatietechnologie, gezondheidszorgsector, wetenschap/onderzoek, ontwikkelaars, eindgebruikers/desktop
Gebruikersinterface
Elektron
Programmeertaal
Python, javascript
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/mirge3/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.