Dit is de Linux-app genaamd MPprimer waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als MPprimer-1.5-macOS-64.tar.bz2. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app genaamd MPprimer met OnWorks gratis online.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
MPprimer
BESCHRIJVING:
Achtergrond: Multiplex PCR, gedefinieerd als de gelijktijdige amplificatie van meerdere regio's van een DNA-template met behulp van meer dan één primerset (bestaande uit een forward primer en een reverse primer) in één buis, is op grote schaal gebruikt in klinische en milieumicrobiologische studies. Het ontwerp van primers voor multiplex-PCR is echter nog steeds een uitdagend probleem en er moeten verschillende factoren in overweging worden genomen. Deze problemen omvatten mis-priming als gevolg van niet-specifieke binding aan niet-doel-DNA-templates, primerdimerisatie en het onvermogen om DNA-amplicons met vergelijkbare elektroforetische mobiliteit te scheiden en te zuiveren.
Resultaten: Een nieuw programma genaamd MPprimer werd ontwikkeld om gebruikers te helpen bij het ontwerpen van primersets voor multiplex PCR met hoge betrouwbaarheid. Het maakt gebruik van het veelgebruikte primerontwerpprogramma Primer3 en het primerspecificiteitsevaluatieprogramma MFEprimer om de kandidaat-primers te ontwerpen en te evalueren op basis van genomische of transcript-DNA-database, gevolgd door zorgvuldig onderzoek om primerdimerisatie te voorkomen.
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/mpprimer/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.