Dit is de Linux-app met de naam OptimizeSNP die online in Linux moet worden uitgevoerd en waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als Optimize1.0code.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam OptimizeSNP online uit om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
OptimaliseerSNP om online in Linux te draaien
BESCHRIJVING:
Het programma past lineaire programmering toe om het aantal microarrays en hybridisatie-experimenten dat moet worden uitgevoerd te minimaliseren om de meeste van de voorspelde uitgedrukte SNP's te dekken. Afhankelijkheden: 1) mampl.exe moet zich in het systeemPATH bevinden. 2) CPLEX 12.2 moet geïnstalleerd zijn. cplexamp.exe moet zich in het systeemPATH bevindenmampl.exe kan worden verkregen vanuit elk programma dat AMPL bevat. Ik heb AMPL verkregen via de proefversie van MOSEK op http://www.mosek.com/. CPLEX 12.0 is verkrijgbaar bij http://www-01.ibm.com/software/integration/optimization/cplex-optimizer/. Een gratis academische licentie kan worden verkregen door de IBM Academic Initiative-aanvraag in te vullen.
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Perl
Database-omgeving
Plat bestand
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/optimizesnp/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.