Dit is de Linux-app met de naam popoolationte waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als popoolationte_1.02.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer gratis online deze app genaamd popoolationte met OnWorks uit.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
pooling
BESCHRIJVING:
PoPoolation TE is een snelle en eenvoudige pijplijn voor de analyse van transponeerbare elementinserties in (natuurlijke) populaties met behulp van next generation sequencing. PoPoolation TE berekent TE-insertiefrequenties voor TE's die aanwezig zijn in het referentiegenoom en voor nieuwe TE-inserties.PoPoolation TE vereist reads met gepaarde uiteinden van een gepoolde populatie, een referentiesequentie en transponeerbare elementsequenties.
Documentatie: https://sourceforge.net/p/popoolationte/wiki/Main/
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/popoolationte/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.