Dit is de Linux-app Scanpy, waarvan de nieuwste versie kan worden gedownload als 1.11.4sourcecode.tar.gz. Deze kan online worden uitgevoerd via de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik online gratis deze app genaamd Scanpy met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCHERMSCHERMEN:
Scheurachtig
BESCHRIJVING:
Scanpy is een schaalbare toolkit voor het analyseren van genexpressiedata van individuele cellen, ontwikkeld in samenwerking met anndata. Het omvat preprocessing, visualisatie, clustering, trajectinferentie en differentiële expressietests. De Python-gebaseerde implementatie verwerkt efficiënt datasets van meer dan een miljoen cellen.
Kenmerken
- Documentatie aanwezig
- Voorbeelden beschikbaar
- Single-cell-analyse in Python
- Het omvat voorverwerking, visualisatie, clustering en trajectinferentie
- De op Python gebaseerde implementatie verwerkt efficiënt datasets van meer dan een miljoen cellen
Programmeertaal
Python
Categorieën
Deze applicatie kan ook worden gedownload van https://sourceforge.net/projects/scanpy.mirror/. Deze is gehost in OnWorks, zodat deze eenvoudig online kan worden uitgevoerd via een van onze gratis besturingssystemen.