Dit is de Windows-app clusterProfiler, waarvan de nieuwste versie kan worden gedownload als clusterProfilersourcecode.tar.gz. Deze kan online worden uitgevoerd via de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer online gratis deze app met de naam clusterProfiler uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCHERMSCHERMEN:
clusterProfiler
BESCHRIJVING:
clusterProfiler is een R/Bioconductor-pakket dat een uniforme workflow biedt voor functionele verrijkingsanalyse om high-throughput omics-resultaten te interpreteren. Het ondersteunt zowel overrepresentatieanalyse als genensetverrijkingsanalyse, waardoor u kunt werken met niet-gerangschikte genenlijsten of gerangschikte statistieken uit differentiële pipelines. Het pakket maakt verbinding met meerdere kennisbanken, zoals Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH en andere, via een consistente interface, zodat u verschillende biologische lenzen kunt raadplegen zonder code te herschrijven. Het is ontworpen voor een breed scala aan toepassingen, met zowel coderende als niet-coderende kenmerken en duizenden organismen, dankzij continu bijgewerkte annotaties. De resultaten worden weergegeven in overzichtelijke, manipulatievriendelijke structuren en worden op natuurlijke wijze gecombineerd met uitgebreide visualisatiefuncties (via companion tooling) om paden, termen en relaties tussen genen en sets samen te vatten.
Kenmerken
- Geünificeerde ORA- en GSEA-workflows over meerdere annotatiebronnen
- Brede soortenondersteuning met behulp van actuele genannotaties
- Nette outputs die netjes integreren met downstream R-datapijplijnen
- Ingebouwde visualisatie van verrijkingsresultaten via bijbehorende plottools
- Hulpprogramma's voor vergelijking van meerdere groepen (bijvoorbeeld compareCluster) voor analyse tussen verschillende omstandigheden
- Gedetailleerde vignetten en handleidingen voor reproduceerbare, end-to-end verrijkingsstudies
Programmeertaal
R
Categorieën
Deze applicatie kan ook worden gedownload van https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. Deze is gehost in OnWorks, zodat deze eenvoudig online kan worden uitgevoerd via een van onze gratis besturingssystemen.