Dit is de Windows-app genaamd HeatmapGenerator waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als HeatmapGenerator5_MacOSX.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd HeatmapGenerator gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCHERMSCHERMEN:
HeatmapGenerator
BESCHRIJVING:
HeatmapGenerator is een softwareprogramma voor een grafische gebruikersinterface geschreven in C++, R en OpenGL om op maat gemaakte genexpressie-heatmaps te maken van RNA-seq- en microarraygegevens in medisch onderzoek. HeatmapGenerator kan ook worden gebruikt om heatmaps te maken op verschillende andere niet-medische gebieden.
HeatmapGenerator is door vakgenoten beoordeelde gepubliceerde software (http://www.scfbm.org/content/9/1/30). Gelieve te citeren: [Khomtchouk et al.: "HeatmapGenerator: High performance RNAseq en microarray visualisatie softwaresuite om differentiële genexpressieniveaus te onderzoeken met behulp van een R en C++ hybride computationele pijplijn." Broncode voor Biologie en Geneeskunde, 2014 9:30]
De broncode van HeatmapGenerator is beschikbaar op: https://github.com/Bohdan-Khomtchouk/HeatmapGenerator
Bohdan Khomtchouk wil de steun van het ministerie van Defensie (DoD) erkennen via het National Defense Science & Engineering Graduate Fellowship (NDSEG)-programma.
HeatmapGenerator is vrijgegeven onder de GNU GPL.
Voordelen
- C ++ programmeertaal
- R programmeertaal
- FLTK grafische gebruikersinterface
- OpenGL: de basis van de industrie voor hoogwaardige grafische afbeeldingen
Gebruikersinterface
OpenGL, FLTK, Koolstof (Mac OS X)
Programmeertaal
C++, S/R
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/heatmapgenerator/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.