Dit is de Windows-app MAF, waarvan de nieuwste versie kan worden gedownload als MAF.zip. Deze kan online worden uitgevoerd via de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik online gratis deze app met de naam MAF met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCHERMSCHERMEN:
MAF
BESCHRIJVING:
DNA- en RNA-nucleotidesequenties zijn een alomtegenwoordig element in alle biologische cellen en dienen enerzijds als een uitgebreide bibliotheek aan mogelijkheden voor de cellen en anderzijds als een indrukwekkend regulatiesysteem om cellulaire functies te controleren. Het gepresenteerde multi-alignment framework (MAF) moet onderzoekers een eenvoudig platform voor sequentie-alignment bieden als functioneel sjabloon, flexibel genoeg om alle stappen aan te passen, maar ook uitgebreid genoeg om veel verschillende tools en aangepaste parametercombinaties te combineren indien diepgaande analyse nodig of wenselijk is, bijvoorbeeld in situaties met een lage leessnelheid. Het platform stelt onderzoekers in staat om meerdere aligner- en verdere verwerkingstools in flexibele combinaties te gebruiken om de subtiele tot opmerkelijke verschillen tussen verschillende alignmentprogramma's en algoritmen die op dezelfde database worden toegepast, te analyseren.
Kenmerken
- Gezamenlijke toepassing van verschillende uitlijningshulpmiddelen, geïllustreerd door bash-scripts
- Flexibele pre- en post-processing stappen, uitbreidbaar en volledig herontwerpbaar
- Bash-sjablonen die ontwikkeltijd besparen
Deze applicatie kan ook worden gedownload van https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/. Deze is gehost in OnWorks, zodat deze eenvoudig online kan worden uitgevoerd via een van onze gratis besturingssystemen.