Dit is de Windows-app genaamd MetaPhat -meta-pheno-association-tracker waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als plasma_lipids_decomposed.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd MetaPhat -meta-pheno-association-tracker gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCHERMSCHERMEN:
MetaPhat -meta-feno-associatie-tracker
BESCHRIJVING:
MetaPhat is een open source-programma voor het detecteren van optimale subsetkenmerken op SNP-lead-associaties van GWAS-samenvattingsresultaten van meerdere biomarkers. De beste kenmerken worden afgeleid van het systematisch ontleden van multivariate associaties in centrale kenmerken op basis van optimale BIC en P-waarde van multivariate CCA-modellen. SNP-traceerresultaten worden geplot en geclusterd om de specificiteit van mv-fenotype-genotype-associaties te ontleden en te verbeteren.
uitgebracht met LD-functie https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Snelle start https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
Ingangen https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
Voorbeeld van wereldwijde lipiden https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
Citeer: Lin et al. (2020) MetaPhat: multivariate associaties detecteren en ontbinden uit univariate genoombrede associatiestatistieken. Voorkant. Genet. doei: 10.
Voordelen
- multivariate genoombrede kenmerkenanalyse
- p-waarde en op BIC gebaseerde selectie van optimale eigenschappensubsets
- trekontledingsspoorplots
- Populatie en LD blokkeren samenklontering
- leidende SNP en samenvattingsbestand van bestuurderskenmerken
- snp-snp eigenschap rang speermancluster
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.