Dit is de Windows-app met de naam RASPnmr die in Windows online via Linux online moet worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als RASP-0.1.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam RASPnmr online uit om gratis in Windows online via Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
RASPnmr wordt online in Windows via Linux online uitgevoerd
BESCHRIJVING:
RASP maakt gebruik van op structuur gebaseerde voorspellingen van chemische verschuivingen om het probleem van de toewijzing van ruggengraatresonantie bij eiwit-NMR-spectroscopie op te lossen. Dit maakt een snelle bepaling van zeer nauwkeurige toewijzingen mogelijk op basis van minimale experimentele datasets, zelfs voor spectroscopisch uitdagende eiwitten.RASP gebruikt als input spinsystemen die zijn samengesteld op basis van een willekeurige reeks conventionele drievoudige-resonantie NMR-experimenten. Uniek is dat RASP in staat is tot uitgebreide toewijzingen, zelfs als er geen informatie over de chemische verschuiving van Cbeta beschikbaar is: over een testset van 154 eiwitten wijst RASP 88% van de residuen toe met een nauwkeurigheid van 99.7%, waarbij alleen informatie wordt gebruikt die beschikbaar is uit HNCO- en HNCA-spectra.
RASP wordt hier beschreven:
MacRaild en Norton (2014) RASP: Snelle en robuuste chemische verschuivingsopdrachten in de ruggengraat van de eiwitstructuur. J Biomol NMR doi:10.1007/s10858-014-9813-7
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, geavanceerde eindgebruikers
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/raspnmr/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.