Jest to polecenie fastaq-to_fasta, które można uruchomić w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
fastaq_to_fasta - Konwertuje różne formaty wejściowe do ładnie sformatowanego formatu FASTA
OPIS
użycie: fastaq_to_fasta [opcje]
Konwertuje różne formaty wejściowe do ładnie sformatowanego formatu FASTA
pozycyjny argumenty:
infile Nazwa pliku wejściowego. Może to być dowolny z FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip
plik wyjściowy
Nazwa pliku wyjściowego
fakultatywny argumenty:
-h, --help
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
-l LINIA_LENGTH, --długość_linii LINIA_LENGTH
Liczba zasad w każdej linii sekwencji pliku wyjściowego. Ustaw na zero dla nie
łamanie linii w sekwencjach [60]
-s, --strip_after_whitespace
Usuń wszystko po pierwszym odstępie w każdej nazwie sekwencji
-u, --check_unique
Giń, jeśli którakolwiek z nazw sekwencji wyjściowych nie jest unikalna
Korzystaj z fastaq-to_fasta online, korzystając z usług onworks.net